Skip to main content
Login | Suomeksi | På svenska | In English

Browsing by Subject "CARS"

Sort by: Order: Results:

  • Pirhonen, Juho; Arola, Johanna; Sädevirta, Sanja; Luukkonen, Panu; Karppinen, Sanna-Mari; Pihlajaniemi, Taina; Isomäki, Antti; Hukkanen, Mika; Yki-Järvinen, Hannele; Ikonen, Elina (2016)
    Maksan rasvoittumisen ajatellaan joskus olevan vain metabolisen oireyhtymän hyvälaatuinen maksamanifestaatio, vaikka se johtaa, erityisesti maksan fibrotisoituessa, kasvaneeseen kardiovaskulaarikuolleisuuteen ja pahimmillaan maksasyöpään. Tästä kansanterveydellisesti merkittävästä roolista huolimatta rasvamaksa on alidiagnosoitu ja sen patogeneettiset mekanismit ovat huonosti ymmärrettyjä, molemmat osin hyvien diagnostisten työkalujen puutteesta johtuen. Päätimme selvittää uusien non-lineaaristen kuvantamismodaliteettien soveltuvuutta rasvamaksan varhaisessa diagnostiikassa. Selvitimme 32 lihavuusleikkauspotilaan maksakudoskoepalojen kudosarkkitehtuurin perinteisin kudosvärjäysmenetelmin ja vertasimme tuloksia samojen potilaiden non-lineaarisesti kuvannettuihin näytteisiin. Kuvansimme minimaalisesti käsitellyistä jääleikkeistä coherent anti-Stokes Raman scattering (CARS) ja second harmonic generation (SHG) signaalit, joita hyödyntäen arvioimme näytteiden rasva- ja kollageenipitoisuuden. Kehitimme myös kuva-analytiikka-algoritmin, joka mahdollistaa kollageenisignaalin automatisoidun ja objektiivisen arvioimisen. Näytteistä mittaamamme SHG- ja CARS-signaalit korreloivat hyvin patologien arvioihin näytteiden fibrotisoitumis- ja rasvoittumisasteista, minkä lisäksi automatisoitu algoritmimme erotteli luotettavasti jopa varhaisen fibroosin normaalista kudoksesta. Myös terveiksi luokiteltujen näytteiden maksakudoksen keskellä esiintyi hienoa fibrillaarista SHG-signaalia. Tunnistamamme SHG-signaali oli spesifiä kolokalisoituen hyvin kollageeni-I- ja III-vasta-ainevärjäyksien kanssa. Tuloksemme osoittavat, että multimodaalisten kuvantamismenetelmien avulla voidaan tunnistaa maksan fibrillaarista kollageenia perinteisiä kudostutkimusmenetelmiä herkemmin. Kehittämämme kuva-analyysi-algoritmi puolestaan arvioi varhaisen fibroosin määrän nopeasti, objektiivisesti ja jatkuvalla skaalalla. Yhdessä nämä löydökset luovat edellytykset tutkia esimerkiksi maksan vähäisen fibroosin kliinistä merkitystä ja paranemistaipumusta isommissa potilasaineistoissa.
  • Saarinen, Jukka (2014)
    The aim of this thesis was to investigate the potential of label-free CARS microscopy as a new method for chemically-specific imaging of live cells and particle-cell interactions in a drug delivery context. Cells used to mimic the intestinal epithelium, Caco-2 cells and HT-29 cells and nano-/ microcrystal particle interactions with macrophages were studied. More information about drug absorption from intestinal and particle cell interactions are needed, since many novel drugs lack properties needed for good bioavailability. It would be beneficial if these events could be visualized without labels. CARS microscopy was found to be well suited to imaging live Caco-2 and HT-29 cells that were grown on PTFE Transwell inserts. CARS microscopy revealed lipid droplets inside these cells. The size of lipid droplets increased in Caco-2 cells a lot during a three week period so that at the end a large part of the inner part of the cell was filled with lipid droplets. It was also observed that Caco-2 cells and HT-29 cells can grow on top of each other on Transwell inserts and not just as a monolayer. These two facts could cause variations in drug absorption studies based on Caco-2 cell monolayers. CARS microscopy was able to detect nanocrystals as small as about 500 nm with label-free, molecular-specific CARS microscope inside RAW 264.7 macrophages after incubation of 120 min. This observation was important, since nanocrystal drug formulations are gaining interest in the field of pharmacy. Nanocrystals can be used in parenteral drug formulations as well as in oral dosage forms. In suspensions, nanocrystals can be used to cause long lasting drug release. Nanocrystals can be also used to enhance poor bioavailability of drugs. Whether these nanocrystals are used in parenteral formulations or in oral drug formulations it is evident that imaging techniques are needed to image interactions between these nanocrystals and cells. CARS microscopy could be one of those techniques, since it is suitable for live cell imaging and it can be used to image nanocrystals that are not labeled. The results in this thesis suggest that CARS microscopy could be used as fast imaging technique for nanocrystal particle cell interactions. Overall, CARS microscopy is a relatively new imaging method that shows much promise as a label-free chemically specific imaging technique for imaging cells and cell-particle interactions in a drug delivery context. As the technique becomes more widely available and undergoes some technical developments, it will become much more widespread imaging method in the future.
  • Rahikainen, Otto (2023)
    Ramansironta on sähkömagneettisen säteilyn ilmiö, jonka avulla voidaan havaita molekyylivärähdyksiä niistä sironneen valon avulla. Kun sähkömagneettinen säteily kohtaa molekyylin se voi häiritä elektronipilveä ytimen ympärillä ja prosessin lopputuloksena energiaa vapautuu sironneen säteilyn muodossa. Tätä kutsutaan epäelastiseksi sironnaksi. Mikäli sironnassa ei tapahdu fotonin energiassa muutosta kyseessä on elastinen siroaminen. Mikäli näytteeseen menevän ja sironneen fotonin välillä havaitaan energian muutos, käytetään ilmiöstä nimeä epäelastinen Raman sironta. Energian muutosta voidaan mitata, ja saatu spektri antaa tietoa kohdemolekyylistä. Tämän työn tarkoituksena oli tutkia eri Raman-spektroskopiatekniikoiden, lähinnä spontaani-Raman spektroskopian sekä koherentti anti-Stokes Ramanspektroskopian ja mikroskopian soveltuvuutta lääkemolekyylien havaitsemiseen sekä nanopartikkeleiden karakterisoinnissa ja nanopartikkeleiden ja solujen välisten interaktioiden tutkimisessa. Tekniikan vahvuuksiin kuuluu käytön suhteellinen helppous ja CARS-mikroskopian nopeus sekä korkea erotuskyky, mahdollisuus havainnoida solunäytteitä, ja epätodennäköisyys vaurioittaa tutkittavaa kohdetta. Haasteisiin lukeutuu fluoresenssin taipumus häiritä signaalia, spontaani-Raman mikroskopian heikompi erottelukyky, analyysin hitaus sekä tarve valikoida molekyyli, jonka rakenne antaisi vahvan Raman-signaalin. Tutkimuksen alatavoitteina oli sopivan lääkemolekyylin valitseminen nanopartikkeliformulaatioon, nanopartikkeleiden formulointi, niiden karakterisointi Raman-spektroskopiatekniikoilla, ja lopulta tutkia Raman spektroskopian soveltuvuutta nanopartikkeleiden ja lääkeaineen sekä solujen interaktioiden tutkimisessa ja lääkeaineen havaitsemisessa solujen sisältä. Tutkimuksessa uutta on se, että ensimmäistä kertaa polymeerinanopartikkeleiden ja niihin ladattujen lääkeaineiden soluunkulkeutumisen tutkiminen pelkällä Raman-spektroskopialla ilman esim. fluoresoivia merkkiaineita. Tutkimuksen tavoitteen pääasiallisesti täyttyivät. Valitsimme kohdemolekyyliksi klorotaloniilin, fungisidin joka on edullinen ja antaa selvästi tunnistettavan Raman-signaalin. Klorotaloniilille suoritettiin normaalit sytotoksisuuskokeet sekä vapaana lääkeaineena että formuloituina nanopartikkeleina. Nanopartikkelien formulointi onnistui ja molemmat Raman-spektroskopiatekniikat näyttivät selvästi sekä lääkemolekyylin että polymeerin kemikaalispesifiset Raman signaalit. Lääkemolekyylin havaitsemin solujen sisältä onnistui. Polymeerimolekyylit eivät missään vaiheessa kulkeutuneet solujen sisälle. Tämä oli ehkä yllättävää koska käytimme makrofageja, mutta toisaalta myös johdonmukainen muiden tutkimusten kanssa. Raman-tekniikat osoittautuivat hyviksi tutkimusmenetelmiksi, ja erityisesti CARS-mikroskoopin suuri erotuskyky osoittautui hyödylliseksi soluunkulkeutumisen kuvantamisessa.
  • Rahikainen, Otto (2023)
    Ramansironta on sähkömagneettisen säteilyn ilmiö, jonka avulla voidaan havaita molekyylivärähdyksiä niistä sironneen valon avulla. Kun sähkömagneettinen säteily kohtaa molekyylin se voi häiritä elektronipilveä ytimen ympärillä ja prosessin lopputuloksena energiaa vapautuu sironneen säteilyn muodossa. Tätä kutsutaan epäelastiseksi sironnaksi. Mikäli sironnassa ei tapahdu fotonin energiassa muutosta kyseessä on elastinen siroaminen. Mikäli näytteeseen menevän ja sironneen fotonin välillä havaitaan energian muutos, käytetään ilmiöstä nimeä epäelastinen Raman sironta. Energian muutosta voidaan mitata, ja saatu spektri antaa tietoa kohdemolekyylistä. Tämän työn tarkoituksena oli tutkia eri Raman-spektroskopiatekniikoiden, lähinnä spontaani-Raman spektroskopian sekä koherentti anti-Stokes Ramanspektroskopian ja mikroskopian soveltuvuutta lääkemolekyylien havaitsemiseen sekä nanopartikkeleiden karakterisoinnissa ja nanopartikkeleiden ja solujen välisten interaktioiden tutkimisessa. Tekniikan vahvuuksiin kuuluu käytön suhteellinen helppous ja CARS-mikroskopian nopeus sekä korkea erotuskyky, mahdollisuus havainnoida solunäytteitä, ja epätodennäköisyys vaurioittaa tutkittavaa kohdetta. Haasteisiin lukeutuu fluoresenssin taipumus häiritä signaalia, spontaani-Raman mikroskopian heikompi erottelukyky, analyysin hitaus sekä tarve valikoida molekyyli, jonka rakenne antaisi vahvan Raman-signaalin. Tutkimuksen alatavoitteina oli sopivan lääkemolekyylin valitseminen nanopartikkeliformulaatioon, nanopartikkeleiden formulointi, niiden karakterisointi Raman-spektroskopiatekniikoilla, ja lopulta tutkia Raman spektroskopian soveltuvuutta nanopartikkeleiden ja lääkeaineen sekä solujen interaktioiden tutkimisessa ja lääkeaineen havaitsemisessa solujen sisältä. Tutkimuksessa uutta on se, että ensimmäistä kertaa polymeerinanopartikkeleiden ja niihin ladattujen lääkeaineiden soluunkulkeutumisen tutkiminen pelkällä Raman-spektroskopialla ilman esim. fluoresoivia merkkiaineita. Tutkimuksen tavoitteen pääasiallisesti täyttyivät. Valitsimme kohdemolekyyliksi klorotaloniilin, fungisidin joka on edullinen ja antaa selvästi tunnistettavan Raman-signaalin. Klorotaloniilille suoritettiin normaalit sytotoksisuuskokeet sekä vapaana lääkeaineena että formuloituina nanopartikkeleina. Nanopartikkelien formulointi onnistui ja molemmat Raman-spektroskopiatekniikat näyttivät selvästi sekä lääkemolekyylin että polymeerin kemikaalispesifiset Raman signaalit. Lääkemolekyylin havaitsemin solujen sisältä onnistui. Polymeerimolekyylit eivät missään vaiheessa kulkeutuneet solujen sisälle. Tämä oli ehkä yllättävää koska käytimme makrofageja, mutta toisaalta myös johdonmukainen muiden tutkimusten kanssa. Raman-tekniikat osoittautuivat hyviksi tutkimusmenetelmiksi, ja erityisesti CARS-mikroskoopin suuri erotuskyky osoittautui hyödylliseksi soluunkulkeutumisen kuvantamisessa.