| dc.date.accessioned |
2017-11-15T10:00:59Z |
|
| dc.date.available |
2017-11-15T10:00:59Z |
|
| dc.date.issued |
2017-11-15 |
|
| dc.identifier.uri |
http://hdl.handle.net/123456789/16129 |
|
| dc.title |
Somatic mutations in clonally expanded cytotoxic T lymphocytes in patients with newly diagnosed rheumatoid arthritis |
en |
| ethesis.discipline |
Internal Medicine |
en |
| ethesis.discipline |
Sisätaudit |
fi |
| ethesis.discipline |
Inre medicin |
sv |
| ethesis.discipline.URI |
http://data.hulib.helsinki.fi/id/02fe8362-e65d-46c3-8bc0-7744c4720460 |
|
| ethesis.faculty |
Lääketieteellinen tiedekunta |
fi |
| ethesis.faculty |
Faculty of Medicine |
en |
| ethesis.faculty |
Medicinska fakulteten |
sv |
| ethesis.faculty.URI |
http://data.hulib.helsinki.fi/id/a4d5aaa2-b5aa-41a7-ba4c-e5e0df7a902d |
|
| ethesis.university.URI |
http://data.hulib.helsinki.fi/id/50ae46d8-7ba9-4821-877c-c994c78b0d97 |
|
| ethesis.university |
Helsingin yliopisto |
fi |
| ethesis.university |
University of Helsinki |
en |
| ethesis.university |
Helsingfors universitet |
sv |
| dct.creator |
Savola, Paula |
|
| dct.creator |
Kelkka, Tiina |
|
| dct.creator |
Rajala, Hanna |
|
| dct.creator |
Kuuliala, Antti |
|
| dct.creator |
Kuuliala, Krista |
|
| dct.creator |
Eldfors, Samuli |
|
| dct.creator |
Ellonen, Pekka |
|
| dct.creator |
Lagström, Sonja |
|
| dct.creator |
Lepistö, Maija |
|
| dct.creator |
Hannunen, Tiina |
|
| dct.creator |
Andersson, Emma |
|
| dct.creator |
Kumar Khajuria, Rajiv |
|
| dct.creator |
Jaatinen, Taina |
|
| dct.creator |
Koivuniemi, Riitta |
|
| dct.creator |
Repo, Heikki |
|
| dct.creator |
Saarela, Janna |
|
| dct.creator |
Porkka, Kimmo |
|
| dct.creator |
Leirisalo-Repo, Marjatta |
|
| dct.creator |
Mustjoki, Satu |
|
| dct.issued |
2017 |
|
| dct.language.ISO639-2 |
eng |
|
| dct.abstract |
Somatic mutations contribute to tumorigenesis. Although these mutations occur in all proliferating cells, their accumulation under non-malignant conditions, such as in autoimmune disorders, has not been investigated. Here, we show that patients with newly diagnosed rheumatoid arthritis have expanded CD8+ T-cell clones; in 20% (5/25) of patients CD8+ T cells, but not CD4+ T cells, harbour somatic mutations. In healthy controls (n=20), only one mutation is identified in the CD8+ T-cell pool. Mutations exist exclusively in the expanded CD8+ effector-memory subset, persist during follow-up, and are predicted to change protein functions. Some of the mutated genes (SLAMF6, IRF1) have previously been associated with autoimmunity. RNA sequencing of mutation-harbouring cells shows signatures corresponding to cell proliferation. Our data provide evidence of accumulation of somatic mutations in expanded CD8+ T cells, which may have pathogenic significance for RA and other autoimmune diseases. |
en |
| dct.abstract |
Kaikissa jakautuvissa solutyypeissä tapahtuu niiden elinkaaren aikana perimän muutoksia eli somaattisia mutaatioita. Somaattiset mutaatiot aiheuttavat syöpää, mutta niiden esiintyvyyttä tai merkitystä muissa sairauksissa kuin syövässä ei ole juuri tutkittu. Tutkimushypoteesinamme on, että autoimmuunisairauksista kärsivien potilaiden valkosoluissa (esimerkiksi T-soluissa) voi esiintyä somaattisia mutaatioita, jotka voivat muuttaa immuunijärjestelmän toimintaa tulehdusta edistäväksi. Tutkiaksemme somaattisia mutaatioita sekvensoimme 25 nivelreumapotilaan ja 20 terveen henkilön T-solujen pääluokat, CD4- ja CD8 –solut, kohdennetulla 986 geeniä kattavalla menetelmällä. Lisäksi sekvensoimme kolmelta potilaalta heidän perimänsä kaikki proteiinia koodaavat alueet. Viideltä nivelreumapotilaalta löytyi yhteensä 30 mutaatiota CD8-soluista, ja yhdeltä terveeltä löytyi yksi mutaatio. Löydetyt mutaatiot esiintyivät vain suurissa CD8-positiivisissa T-soluklooneissa, eivät kaikissa CD8 T-soluissa. Mutaatiot löytyivät potilaiden soluista myös seurantanäytteistä. Useat mutaatioita kantavista geeneistä osallistuvat immuunijärjestelmän toimintaan tai solunjakautumiseen. Mutaatioita kantavat solut ilmensivät solun kasvuun tai eloonjäämiseen liittyviä geenejä. Vaikka mutaatioiden merkitystä nivelreuman taudinkulussa ei voida vielä osoittaa, tulokset viittaavat siihen, että autoimmuuni- ja syöpäsairauksilla on yhteisiä molekyylitason ominaisuuksia. |
fi |
| dct.subject |
T-solu |
fi |
| dct.subject |
CD8+ T-solu |
fi |
| dct.subject |
lymfosyytti |
fi |
| dct.language |
en |
|
| ethesis.language.URI |
http://data.hulib.helsinki.fi/id/languages/eng |
|
| ethesis.language |
English |
en |
| ethesis.language |
englanti |
fi |
| ethesis.language |
engelska |
sv |
| ethesis.supervisor |
Mustjoki, Satu |
|
| ethesis.thesistype |
pro gradu-avhandlingar |
sv |
| ethesis.thesistype |
pro gradu -tutkielmat |
fi |
| ethesis.thesistype |
master's thesis |
en |
| ethesis.thesistype.URI |
http://data.hulib.helsinki.fi/id/thesistypes/mastersthesis |
|
| dct.identifier.ethesis |
E-thesisID:d4a9e647-ebf0-4585-94cf-699965e3a13b |
|
| ethesis.degreeprogram |
Lääketieteen koulutusohjelma |
fi |
| ethesis.degreeprogram |
Medical curriculum |
en |
| ethesis.degreeprogram |
Medicinska utbildningsprogrammet |
sv |
| ethesis.degreeprogram.URI |
http://data.hulib.helsinki.fi/id/767842ad-05d0-4813-84df-c487f341f1ca |
|
| ethesis-internal.timestamp.reviewStep |
2017-10-05 08:55:18:021 |
|
| dct.identifier.urn |
URN:NBN:fi:hulib-201711155711 |
|
| dc.type.dcmitype |
Text |
|
| dct.subject.mesh |
Nivelreuma
|
fi |
| dct.subject.mesh |
DNA-mutaatioanalyysi |
fi |
| dct.subject.mesh |
Mutaatio
|
fi |
| dct.subject.mesh |
CD8-solut |
fi |
