dc.date.accessioned |
2007-02-13T11:07:47Z |
en |
dc.date.accessioned |
2009-09-01T08:02:24Z |
und |
dc.date.accessioned |
2018-07-30T07:41:11Z |
|
dc.date.available |
2007-02-13T11:07:47Z |
en |
dc.date.available |
2009-09-01T08:02:24Z |
und |
dc.date.available |
2018-07-30T07:41:11Z |
|
dc.date.issued |
2005 |
|
dc.identifier.uri |
http://hdl.handle.net/1975/1116 |
|
dc.description |
Vain tiivistelmä. Koko työ lainattavissa Viikin tiedekirjastosta. |
fi |
dc.format.extent |
24 bytes |
en |
dc.format.mimetype |
text/plain |
en |
dc.publisher |
University of Helsinki |
en |
dc.publisher |
Helsingin yliopisto |
fi |
dc.publisher |
Helsingfors universitet |
sv |
dc.title |
Mykobakteerien määrittäminen vesijohtoverkon biofilmeistä reaaliaikaisella PCR-menetelmällä |
fi |
dc.type |
Thesis |
en |
ethesis.discipline |
Microbiology |
en |
ethesis.discipline |
Mikrobiologia |
fi |
ethesis.discipline |
Mikrobiologi |
sv |
ethesis.department |
Institutionen för basveterinärmedicin |
sv |
ethesis.department |
Department of Basic Veterinary Sciences |
en |
ethesis.department |
Peruseläinlääketieteen laitos |
fi |
ethesis.faculty |
Faculty of Veterinary Medicine |
en |
ethesis.faculty |
Veterinärmedicinska fakulteten |
sv |
ethesis.faculty |
Eläinlääketieteellinen tiedekunta |
fi |
ethesis.faculty.URI |
http://data.hulib.helsinki.fi/id/f3d16a17-630c-43fb-86ad-031dba66d6a9 |
|
ethesis.university.URI |
http://data.hulib.helsinki.fi/id/50ae46d8-7ba9-4821-877c-c994c78b0d97 |
|
ethesis.university |
Helsingfors universitet |
sv |
ethesis.university |
University of Helsinki |
en |
ethesis.university |
Helsingin yliopisto |
fi |
dct.creator |
Hintsa, Hannamari Helena |
|
dct.issued |
2005 |
|
dct.language.ISO639-2 |
fin |
|
dct.abstract |
Syventävät opinnot tehtiin osana HAIVE-yhteistyöprojektia Helsingin yliopiston Eläinlääketieteellisen tiedekunnan peruseläinlääketieteen laitoksen, Haartman-instituutin virologian yksikön, Tampereen teknillisen korkeakoulun Bio- ja ympäristötekniikan laitoksen, Helsingin veden, Tampereen veden, Turun vesilaitoksen, Raision-Naantalin vesilaitoksen, Hämeenlinnan Seudun Vesi Oy:n, TAVASE Oy:n ja Oulun vesilaitoksen kanssa.
HAIVE-projektin mykobakteerisouuden tavoitteena oli kehittää nopea detektointimenetelmä mykobakteerien määrittämiseksi vesijohtoverkon vedestä ja biofilmeistä. Määritykseen käytettiin reaaliaikaikaiseen PCR:ään perustuvaa tekniikkaa.
Tämän työn tarkoituksena oli kehitetyn menetelmän käyttöönotto ja menetelmän käyttäjäystävällisyyden arviointi. Lisäksi tavoitteena oli kehittää HAIVE-projektin menetelmää erityisesti DNA:n eristysmenetelmän osalta. Biofilmeissä esiintyvien mykobakteerien havaitsemiseksi käytettiin kvantitatiivisen PCR:n (qPCR) lisäksi perinteisiä viljelymenetelmiä.
Tutkimuksessa käytetty kirjallisuudesta sovellettu DNA:n eristysmenetelmä osoittautui tehokkaaksi biofilmien mykobakteerimäärien ollessa suuria mutta ongelmalliseksi silloin kun mykobakteerimäärät olivat vähäisiä. qPCR menetelmä osoittautui nopeaksi ja spesifiseksi menetelmäksi. Työssä tutkituista biofilmeistä ei löydetty mykobakteereita.
Tulevaisuudessa DNA:n eristysmenetelmää on kehitettävä edelleen, sillä vesijohtoverkon biofilmeissä mykobakteerimäärät ovat todennäköisesti niin vähäisiä, että monivaiheisen DNA:n eristyksen seurauksena qPCR tulos saattaa olla virheellisesti negatiivinen. Tämän työn perusteella qPCR ei korvaa perinteisiä viljelymenetelmiä silloin kun näytteiden mykobakteerimäärät ovat vähäiset. |
fi |
dct.subject |
ympäristömykobakteerit |
fi |
dct.subject |
vesijohtoverkko |
fi |
dct.subject |
kvantitatiivinen PCR (qPCR) |
fi |
dct.language |
fi |
|
ethesis.language.URI |
http://data.hulib.helsinki.fi/id/languages/fin |
|
ethesis.language |
Finnish |
en |
ethesis.language |
suomi |
fi |
ethesis.language |
finska |
sv |
dct.identifier.urn |
URN:NBN:fi-fe201801151790 |
|
dc.type.dcmitype |
Text |
|
dc.identifier.laitoskoodi |
E9000 |
|
dct.subject.ysa |
vesijohtoverkot |
fi |
dct.subject.ysa |
biofilmit |
fi |
dc.format.content |
abstractOnly |
|