| dc.date.accessioned |
2007-02-14T09:46:03Z |
en |
| dc.date.accessioned |
2009-09-01T07:59:59Z |
und |
| dc.date.accessioned |
2018-07-30T07:39:14Z |
|
| dc.date.available |
2007-02-14T09:46:03Z |
en |
| dc.date.available |
2009-09-01T07:59:59Z |
und |
| dc.date.available |
2018-07-30T07:39:14Z |
|
| dc.date.issued |
2002 |
|
| dc.identifier.uri |
http://hdl.handle.net/1975/1181 |
|
| dc.description |
Vain tiivistelmä. Koko työ lainattavissa Viikin tiedekirjastosta. |
fi |
| dc.format.extent |
24 bytes |
en |
| dc.format.mimetype |
text/plain |
en |
| dc.publisher |
University of Helsinki |
en |
| dc.publisher |
Helsingin yliopisto |
fi |
| dc.publisher |
Helsingfors universitet |
sv |
| dc.title |
Aeromonas-lajien tunnistaminen HSP60-geenin polymorfian avulla |
fi |
| dc.type |
Thesis |
en |
| ethesis.discipline |
Environmental Hygiene |
en |
| ethesis.discipline |
Ympäristöhygienia |
fi |
| ethesis.discipline |
Miljöhygien |
sv |
| ethesis.department |
Institutionen för livsmedel och miljöhygien |
sv |
| ethesis.department |
Department of Food and Environmental Hygiene |
en |
| ethesis.department |
Elintarvike- ja ympäristöhygienian laitos |
fi |
| ethesis.faculty |
Faculty of Veterinary Medicine |
en |
| ethesis.faculty |
Veterinärmedicinska fakulteten |
sv |
| ethesis.faculty |
Eläinlääketieteellinen tiedekunta |
fi |
| ethesis.faculty.URI |
http://data.hulib.helsinki.fi/id/f3d16a17-630c-43fb-86ad-031dba66d6a9 |
|
| ethesis.university.URI |
http://data.hulib.helsinki.fi/id/50ae46d8-7ba9-4821-877c-c994c78b0d97 |
|
| ethesis.university |
Helsingfors universitet |
sv |
| ethesis.university |
University of Helsinki |
en |
| ethesis.university |
Helsingin yliopisto |
fi |
| dct.creator |
Juntunen, Pekka |
|
| dct.issued |
2002 |
|
| dct.language.ISO639-2 |
fin |
|
| dct.abstract |
Aeromonas-bakteerit ovat gram-negatiivisia, sauvamaisia ja fakultatiivisia anaerobisia bakteereita. Tällä hetkellä tunnetaan jo 16 tai 17 Aeromonas-lajia (genospecies=GS tai hybridization/homology group=HG), mutta aeromonaksille ei ole olemassa yleisesti hyväksyttyä luokittelua. Taksonomia muuttuu jatkuvasti uusien tutkimusten ja tunnistamismenetelmien perusteella. Nykyään luokittelussa yleisesti käytetyt hybridisaatioryhmät ovat toisinaan ristiriidassa perinteisten biokemiallisten ja fysiologisten ominaisuuksien perusteella luokiteltujen lajien kanssa.
HSP60 (heat shock protein 60, GroEL tai Cpn60) on yleinen ja konservoitunut lämpösokkiproteiini, jota esiintyy kaikissa mikrobeissa. Tämän vuoksi HSP60-geenifragmentin polymorfiaa on käytetty apuna eri bakteerisukujen ja -lajien taksonomian tutkimisessa.
Tämän tutkimuksen tarkoituksena oli kehittää eri Aeromonas-lajien tunnistamiseen sopiva menetelmä, joka perustuu HSP60-geenin polymorfiaan, jota tutkitaan restriktiofragmenttien pituuspolymorfian (RFLP) avulla. Ensin monistettiin polymeraasiketjureaktion (PCR) avulla osa HSP60-geenistä 76 Aeromonas-kannalta (HG 1 - HG 12 ja HG 16). Geenifragmenttien pilkkomista kokeiltiin useilla restriktioentsyymeillä. Parhaiten eri lajit erotteleviksi entsyymeiksi osoittautuivat HhaI ja MboI, joilla pilkottiin kaikki monistuneet HSP60-geenifragmentit. RFLP:llä saadut fragmentit kuvattiin UV-valossa ja analysoitiin Bionumerics-ohjelmalla. Lopuksi analyysituloksia tulkittiin visuaalisesti.
Tutkimus osoitti, että nyt kehitetty Aeromonas-lajien tunnistamismenetelmä onnistuu tutkituista 13 genotyypistä erottelemaan toisistaan kahdeksan genotyyppiä: A. hydrophila (HG 1), A. bestiarum (HG 2), A. caviae (HG 4), A. veronii (HG 8/10 ja 10), A. jandaei (HG 9), A. sp. HG 11, A. schubertii (HG 12) ja A. encheleia (HG 16).
Aeromonasten tunnistaminen HSP60-geenin polymorfian avulla on nopea ja luotettava menetelmä, jonka kehittämistä kaikkien tunnettujen Aeromonas-lajien tunnistamiseksi kannattaa jatkaa. |
fi |
| dct.subject |
Aeromonas |
|
| dct.subject |
HSP60 |
|
| dct.subject |
PCR |
|
| dct.subject |
RFLP |
|
| dct.subject |
taksonomia |
fi |
| dct.language |
fi |
|
| ethesis.language.URI |
http://data.hulib.helsinki.fi/id/languages/fin |
|
| ethesis.language |
Finnish |
en |
| ethesis.language |
suomi |
fi |
| ethesis.language |
finska |
sv |
| dct.identifier.urn |
URN:NBN:fi-fe201801151563 |
|
| dc.type.dcmitype |
Text |
|
| dc.identifier.laitoskoodi |
E9000 |
|
| dc.format.content |
abstractOnly |
|
