Browsing by Author "Hyvönen, Elviira"

Vasemman kammion vajaakehitysoireyhtymä eli HLHS on vakava synnynnäinen sydänvika. HLHS:n on osoitettu olevan osassa tapauksista perinnöllinen sairaus, mutta sairauden monimutkainen tautimekanismi on hankaloittanut geneettisen taustan selvittämistä. Uuden sukupolven sekvensointimenetelmät sekä indusoidut pluripotentit kantasolut eli iPS-solut ovat tuoneet uusia mahdollisuuksia HLHS:n tautimekanismin tutkimiseksi. Äskettäin julkaistussa tutkimuksessa havaittiin todennäköisesti haitallinen NOTCH1-geenin silmukointialueen variantti HLHS-potilaalla. Tämän tutkielman tavoitteena on kyseisen NOTCH1-geenivariantin karakterisointi, sekä variantin patogeneettisten mekanismin selvitys kyseisen HLHS-potilaan soluista tuotetun iPS-solumallin avulla. Tässä tutkielmassa iPS-soluja erilaistettiin sydänlihassoluiksi ja erilaistamisen aikana mitattiin useiden sydämen kehityksen aikaisten geenimarkkereiden ilmenemistä qPCR-menetelmällä. NOTCH1-geenin sekvensointi osoitti kyseessä olevan fenotyypiltään terveeltä isältä peritty variantti, jonka havaittiin aiheuttavan 30 emäksen deleetion RNA:ssa, mikä viittaa kyseisen variantin haitallisuuteen. iPS-solujen qPCR-analyysi ei kuitenkaan osoittanut eroavaisuutta NOTCH1-geenin ilmenemisessä. Muiden tutkittujen geenimarkkereiden osalta poikkeavuutta solulinjojen välillä havaittiin TBX5 transkriptiotekijän ilmenemisessä. Lisäksi NOTCH1-variantin karakterisoimiseksi kehitettiin metodia Notch1-reseptorin stimuloimiseksi. Tutkielmassa kuvattu iPS-solumalli tarjoaa esimerkin nykyaikaisesta menetelmästä karakterisoida löydettyjen geenivarianttien merkitystä monimutkaisesti periytyvissä sairauksissa.