Skip to main content
Login | Suomeksi | På svenska | In English

Browsing by Subject "drug screening"

Sort by: Order: Results:

  • Turunen, Minna (2020)
    Nykyiset prekliiniset syöpälääkekokeet ennustavat huonosti lääkeaihioiden tehoa myöhemmissä kliinisissä tutkimuksissa. FM Katja Tuomainen professori Tuula Salon tutkimusryhmässä lähti selvittämään, parantaisiko Myogeeli, ihmiskasvainperäinen matriksi, in vitro -syöpälääketestauksen kliinistä ennustettavuutta. Hypoteesina oli, että humaania tuumorin mikroympäristöä mimikoiva Myogeeli tarjoaisi perinteiseen muovialustaan ja Matrigeeliä hyödyntäviin asetelmiin verrattuna parhaimman kasvualustan syöpäsoluille ja sitä kasvatusalustana käyttäen saataisiin tulokset, jotka olisivat parhaiten samassa linjassa kliinisten kokeiden tutkimustulosten kanssa. Osallistuin Tuomaisen tutkimukseen keräämällä ClinicalTrials.gov-tietokannasta kunkin tutkittavan lääkeaineen osalta kliinisten kokeiden tiedot tutkimustuloksineen, jotta Tuomaisen tutkimuksen eri ympäristössä kasvaneiden syöpäsolujen lääkevasteita voitiin vertailla kliinisten kokeiden tutkimustuloksiin. Tutkimus julkaistiin joulukuussa 2019 Cancers-julkaisussa (Tuomainen K, Al-Samadi A, Potdar S, Turunen L, Turunen M, et al. Human Tumor–Derived Matrix Improves the Predictability of Head and Neck Cancer Drug Testing. Cancers 2019; 12, 92) ja olin siinä yhtenä kirjoittajista. Kliinisistä tutkimuksista keräämääni tietoa sekä Tuomaisen tutkimuksen tuloksia käydään läpi tässä syventävän tutkielman kirjallisessa osassa. Tätä pohjustamaan tutkielman alussa on kirjallisuuskatsaus, jossa tutustutaan pään ja kaulan alueen syöpiin, syöpälääkekehitykseen, nykyisin käytössä oleviin prekliinisiin tutkimusasetelmiin sekä Tuomaisen tutkimuksessa testattuihin pään ja kaulan alueen syöpälääkkeisiin. Tuomaisen tutkimuksessa havaittiin syöpäsolujen lääkeainevasteiden vaihtelevan eri kasvuympäristöissä; siinä missä vasteet PI3K/mTOR-inhibiittoreihin olivat samansuuntaiset kasvuympäristöstä riippumatta, EGFR- ja MEK-inhibiittorit toimivat hyvin muovilla ja Matrigeelissa, mutta eivät Myogeelissa. Vertailluissa kliinisissä kokeissa EGFR-inhibiittorit toimivat myös kehnosti, ja tutkimustulosten katsottiin puoltavan tutkimushypoteesia.
  • Bobik, Nina (2022)
    Despite recent advances in immunotherapies for lung cancer, their success is still hindered by limited predictability of treatment outcomes in patients, as well as by resistance-conveying tumor mutations such as EGFR. Moreover, due to the vast number of treatment options and their cost, a quick, reliable, and cost-efficient drug screening platform is needed to select the optimal treatments for each individual patient. This thesis focuses on finding the best culture conditions to be used in such a future platform, employing 3D cell cultures and microfluidics to mimic in vivo tumors while saving costs and allowing for high-throughput screening. Image-based analysis showed that culture medium can have significant impacts on both cancer organoid growth and morphology, as well as drug sensitivity to the EGFR-inhibiting drug Osimertinib. Specific medium factors, such as the antioxidant N-acetylcysteine, might be particularly important for the integrity of 3D structures in the platform and help prevent conversion to an adherent morphology. Moreover, flow cytometry analysis of immune cells from pleural effusion samples indicated that medium composition might facilitate creating an inflammatory environment in the platform, and that immune cells should not be cultured longer than one week to maximize their activity. Finally, this thesis compares two microfluidic devices for their suitability to be used in future high-throughput drug-screening applications, by contrasting their ease of handling, applicability in fluorescent imaging-based readouts, and possibility to mimic and study the tumor microenvironment in vitro. The results suggest that the choice of microfluidic device will be dependent on whether microscopy analysis or cell viability assays will be used as the main readout of the drug screening in the future.