Hemiselluloosat ovat kasviperäisiä polysakkarideja, joiden kemiallisen ja entsymaattisen hydrolyysin seurauksena syntyy oligosakkarideja. Näiden oligosakkaridien analytiikka on haastavaa, sillä ne ovat rakenteiltaan hyvin erilaisia ja ne eivät sisällä normaaliolosuhteissa esimerkiksi ultraviolettisäteilyä absorboivia ryhmiä. Derivatisoimattomia neutraaleja ksylo- ja arabinoksylo-oligosakkarideja voidaan analysoida kvalitatiivisesti kapillaarielektroforeesilla emäksisissä olosuhteissa ja ne voidaan havaita ultravioletti-ilmaisimella. Menetelmän muokkaaminen myös kvantitatiiviseen analyysiin sopivaksi vaikuttaa mahdolliselta. Lisäksi kapillaarielektroforeesilla voidaan analysoida pelkistävän aminaation avulla derivatisoituja ksylo- ja malto-oligosakkarideja nopeasti hyödyntämällä niiden muodostamia boraattikomplekseja. Kapillaarielektroforeesi on nopea, luotettava ja ympäristöystävällinen menetelmä hiilihydraattien analyysiin.
