Browsing by Author "Koivula, Anna-Stiina"

Ihmiselimistön ksenobiootteja metaboloiva entsyymi N-asetyylitransferaasi 1 (NAT1) osallistuu karsinogeenien biotransformaatioon, joten sillä ajatellaan olevan merkittävä rooli syövän kehittymisessä. Useissa aiemmissa tutkimuksissa on havaittu tätä entsyymiä koodaavan geenin aktiivisuuden kasvaneen etenkin rintasyövissä. Projektin tavoitteena oli tutkia NAT1-geenin ilmentymistasoja eri rintasyövän alatyypeissä qPCR:llä. The Cancer Genome Atlas- projektin rintasyöpänäytteillä NAT1-geenin ja miR- 1323 välillä nähtiin selkeä negatiivinen korrelaatio ja tarkoitus oli tutkia, miten miR-1323 säätelee NAT1-geenin ilmentymistä. Lisäksi tutkittiin NAT1:n roolia lääkeainevasteissa hiljentämällä tämä geeni lentivirustransduktiolla. Virustransduktioon valikoitiin kaksi rintasyöpäsolulinjaa, MDA-MB-231 sekä ZR-75-1, jotka tehtyjen qPCR:n ja Western-blot analyysien tulosten mukaan ilmensivät voimakkaasti NAT1-geeniä. Geenin hiljentämisen jälkeen näytteille suoritettiin Western blot- analyysi NAT1- ekspressiotasojen määrittämiseksi, jotta voitaisiin valita lääkeainetestejä varten kummastakin solulinjasta eniten geenin ilmentymistasoon vaikuttanut viruskonstrukti. Lääkeaineseulonnassa testattiin 311 lääkeaineen vastetta MDA-MB-231 ja ZR-75-1-syöpäsolulinjojen kontrollisoluissa sekä NAT1- hiljennetyissä soluissa. Tuloksissa keskityttiin lääkeaineisiin, joiden tehokkuus merkittävästi kohosi, kun NAT1-geeni oli hiljennetty. Tällaisia lääkkeitä olivat MDA-MB-231:n kohdalla navitoclax ja ZR-75-1:n kohdalla sisplatiini, simvastatiini, volasertib, dacomitinib sekä ABT-199. Tutkimus osoitti NAT1-geenin ilmentymistasojen olevan merkittävä vasteeseen vaikuttava tekijä näiden lääkkeiden kohdalla. Jatkossa NAT1-geeni voisi olla potentiaalinen lääkekohde tai sen ilmentymistasoja voisi käyttää biomarkkerina arvioitaessa tiettyjen lääkeaineiden tehoa rintasyövässä.