Browsing by Subject "syväoppiminen"
Now showing items 1-1 of 1
-
Koirien ja kissojen suolistoloisten tunnistaminen ulostenäytteistä Vetscan Imagyst-analysaattorilla (2024)Koirilla ja kissoilla esiintyy useita suolistoloisia, jotka voivat aiheuttaa isännälleen terveyshaittoja tai muodostaa ihmisille zoonoosiriskin. Suomessa rutiiniloishäätöjä parempi lähestymistapa monessa tapauksessa on tutkia ulostenäyte ja lääkitä eläin vain tarvittaessa. Siksi tarve kustannustehokkaalle, luotettavalle, herkälle ja helppokäyttöiselle menetelmälle loisten osoittamiseksi ulosteista on ilmeinen. Pitkään käytössä olleiden (useimmiten flotaatioon perustuvien) menetelmien rinnalle on viime aikoina kehitetty tekoälyä hyödyntäviä laitteistoja, jotka voivat vastata osaltaan tähän tarpeeseen. Niiden etuna perinteisiin manuaalisiin menetelmiin verrattuna on näytteen analysoijasta johtuvan vaihtelun poistaminen sekä nopea ja standardoitu näytteenkäsittely. Tutkimuksessa selvitettiin miten hyvin tekoälyä ja syväoppimista hyödyntävä Vetscan Imagyst -analysaattori löytää ja tunnistaa koirien ja kissojen ulostenäytteistä sisäloisten munia ja kystamuotoja ja verrattiin laitteen antamia tuloksia yleisesti käytössä olevien manuaalisten flotaatiomenetelmien antamiin tuloksiin. Oletuksena oli, että Vetscan Imagyst -menetelmä pystyisi tunnistamaan näytteistä suolistoloisten munat/kystamuodot yhtä hyvin kuin manuaaliset menetelmät. Näytteenä käytettiin Yliopistollisen eläinsairaalan keskuslaboratorioon (YESLAB) lähetettyjä kissojen ja koirien ulostenäytteitä, joista oli tilattu ulosteen sisäloistutkimus flotaatiomenetelmällä (n=42). Tutkimukset tehtiin loka-joulukuussa 2021. Näytteet tutkittiin YESLAB:ssa käytössä olevalla muunnoksella passiivisesta flotaatiomenetelmästä (modifioitu passiivinen flotaatiomenetelmä), sentrifugaatioflotaatiolla parasitologian laboratoriossa sekä Vetscan Imagyst -analysaattorilla. Sekä modifioidussa passiivisessa flotaatiomenetelmässä että sentrifugaatioflotaatiomenetelmässä flotaatioliuoksena käytettiin magnesiumsulfaattia. Menetelmien herkkyyttä tutkittiin etukäteen Toxocara-munilla ympätyillä näytteillä. Tutkimuksessa löytyi kaksi Toxocara-, yksi Trichuris-, yksi Capillaria- ja 13 kokkidialkueläinpositiivista näytettä. Vetscan Imagyst tunnisti kaikki positiiviset näytteet, joskin se nimesi Capillarian väärin Trichurikseksi ja kaikki kokkidit Cystoisosporiksi vaikka yhtä näytettä lukuun ottamatta kaikki havaitut kokkidit olivat Eimerioita. Lisäksi Vetscan Imagyst -menetelmällä tuli kolme virhepositiivista löydöstä. Sentrifugaatioflotaatiomenetelmä ei löytänyt Trichuris-positiivista näytettä eikä yhtä kokkidipositiivista näytettä. Modifioitu passiivinen flotaatiomenetelmä toimi heikoiten ja jätti löytämättä kahdeksan loispositiivista näytettä. Modifioidulla passiivisella flotaatiomenetelmällä tai sentrifugaatioflotaatiomenetelmällä ei tullut virhepositiivisia tuloksia. Kun menetelmien herkkyyttä arvioitiin etukäteen ympätyillä näytteillä, sentrifugaatioflotaatiomenetelmä löysi määrällisesti enemmän Toxocara canis munia kuin Vetscan Imagyst. Vetscan Imagyst on helppo- ja nopeakäyttöinen ja se erottaa hyvin näytteissä olevat loisten munat ja kystamuodot. Syväoppimista hyödyntävänä menetelmänä Vetscan Imagyst tulee todennäköisesti tunnistamaan havaitut löydökset jatkossa entistä paremmin algoritmien tarkennuttua.
Now showing items 1-1 of 1