Skip to main content
Login | Suomeksi | På svenska | In English

Browsing by Subject "geeninsiirto"

Sort by: Order: Results:

  • Hannila, Teija (2013)
    Gene therapy is an experimental technique that involves inserting therapeutic genes into the target cells to treat diseases. Gene transfer can be performed by ex vivo or in vivo method. Ex vivo method means transferring the therapeutic gene in laboratory to the cells that are removed from the patient, after which the cells are returned to the patient. In the in vivo method the gene transfer is performed directly to the target tissue inside the patient's body. Gene therapy clinical trials have been carried out to treat many diseases. The majority of the clinical trials have so far been cancer trials. Nevertheless, the most promising results have been established in treating diseases that arise from mutations in a single gene, i.e. monogenic diseases. Monogenic diseases include e.g. hemophilia and heritable immunodeficiencies. The biggest challenges in the clinical trials so far have been the limited gene transfer efficiency of the currently used gene vectors, the short duration of the transgene expression and the side-effects in viral-mediated gene transfer. Nonviral gene transfer agents have so far been less efficient in vivo than the viral vectors. This is partly due to the interaction between serum components and nonviral vectors. The main purpose of this study was to investigate the effect of serum to the gene transfer efficiency of a nonviral vector polyethyleneimine PEI22K and the combination of PEI22K and cationic liposome Dosper in vitro in the SMC-cells. The potential synergistic increase in the transfection efficiency of PEI22K/Dosper combination was also studied. The secondary goal in this study was to develop an in vitro model which could be used to predict the gene transfer efficiency of gene vectors in vivo. The combination of PEI22K and Dosper resulted in a synergistic increase in the transfection efficiency in serum-free transfection. In the presence of serum the efficiency of PEI22K was higher than the efficiency of PEI22K/Dosper combination. 1-10% serum concentrations did not significantly affect PEI22K`s transfection efficiency, but dramatically decreased the efficiency of PEI22K/Dosper combination. The results suggest that PEI22K is more suitable than PEI22K/Dosper combination for in vivo gene transfer.
  • Keskimäki, Sanne (2023)
    Plasmidit ovat geneettisiä elementtejä, joita voidaan käyttää esimerkiksi geeninsiirtovektoreina. Transposonit ovat DNA-fragmentteja, joilla on kyky siirtyä genomissa paikasta toiseen. Tutkimuksessa käytettävä transposoni on piggyBac, joka on eristetty tupsumetalliyökkösen (Trichoplusia ni) soluista. Transpositiossa piggyBac tunnistaa ITR-osat (käännetty terminaalinen toistojakso) siirtäen osien välissä olevan DNA:n. Tutkimuksen tavoitteena oli tuottaa kaksi erilaista plasmidia. pAc5.1-piggyBac-plasmidiin sisällytettiin piggyBac ja pMT-In-EGFP-PB-ITR-plasmidiin ITR-osat sekä niiden väliin hygromysiiniresistenssigeeni sekä EGFP-geeni. BTI-Tn-5B1-4-solujen DNA:sta eristettiin piggyBac sekä ITR-osat ja ne siirrettiin plasmidiin pTOPO-piggyBac-R. Tästä plasmidista irrotettiin erilleen piggyBac ja ITR-osat, joista välivaiheiden kautta rakennettiin lopulliset plasmidit. Plasmidit rakennettiin pitkälti pilkkomalla DNA-fragmentteja restriktioentsyymeillä ja yhdistämällä niitä ligaatiolla. Plasmideja tuotettiin suurempia määriä siirtämällä niitä transformaation avulla E.Coli-soluihin lämpöshokkimenetelmällä ja eristämällä tämän jälkeen saadut plasmidit. Tuotettujen plasmidien onnistuminen varmistettiin pilkkomalla ne restriktioentsyymeillä ja tutkimalla DNA-fragmenttien kokoa agaroosigeelielektroforeesilla. Plasmidinäytteet myös sekvensoitiin osittain. Banaanikärpäsen (Drosophila melanogaster) S2-solut transfektoitiin kehitetyillä plasmideilla ja solukonsentraatioita sekä elinkelpoisuutta mitattiin 8 päivän ajan transfektion jälkeen. Tavoitteena oli hyödyntää EGFP-geeniä fluoresenssimittauksiin. Solunäytteisiin lisättiin kokeen aikana hygromysiini, jotta voitiin selvittää, olivatko viljellyt solut saavuttaneet hygromysiiniresistenssin. Tutkimuksen tuloksena plasmidit saatiin kehitettyä, mutta solukokeiden tulokset jäivät epäselviksi. Solunäytteissä ilmeni kasvatuksen aikana kontaminaatioita. Lisäksi EGFP-osia ei voitu luotettavasti mitata käytössä olleella laitteella. Transfektio tulee siis toistaa transposonisysteemin toiminnan tutkimiseksi. Lisäkokeilla voidaan selvittää tarkemmin kehitetyn transposonisysteemin mahdollisuuksia sekä toiminnan yksityiskohtia.