Skip to main content
Login | Suomeksi | På svenska | In English

Browsing by Title

Sort by: Order: Results:

  • Levitski, Andres (2020)
    Objectives Fatigue is a major factor affecting driving performance and traffic accident risk. Driving conditions influence how people experience fatigue while driving. Driving in demanding conditions may increase vigilance in tired drivers; however, it may also increase cognitive load and become an additional source of fatigue. The current study investigated how driving on a slippery road interacts with fatigue caused by sleep deprivation and how it influences driving performance. Methods Twelve male participants (aged 19–21) drove 52.5 km in a driving simulator in four different conditions (day vs night and dry vs slippery road). Subjective sleep-related fatigue was measured with the Karolinska Sleepiness Scale and physiological fatigue in blink durations with electro-oculography. Three measures were used for driver performance: standard deviation of lateral position, mean steering wheel movement amplitude and mean steering wheel movement peak velocity. After each driving session, participants negotiated a cone track. The success rate for this task was analysed separately. Results Driving on slippery roads improved performance in all three performance metrics in sleep-deprived drivers. The three-way interaction between driver condition, road condition and time-on-task was significant for subjective sleep-related fatigue but not for performance. Sleep-deprived drivers became increasingly sleepy over time when driving in slippery conditions; however, this did not negatively affect their performance. Conclusions Driving in demanding weather conditions can increase the fatigue experienced by drivers; however, this change may not be initially detectable in performance. Large individual variability in response to both fatigue and driving conditions requires further research.
  • Kaisto, Soila (2020)
    Objectives. This study examines the effects of low birth weight (LBW) and perinatal hyperbilirubinemia (HB) on interference control in adulthood. The study questions are whether LBW and HB are associated with interference control difficulties in adulthood, and whether increasing cognitive load affects the association. Based on previous research on perinatal risk factors and executive functioning, the hypotheses were that individuals with LBW and HB would show a greater change in reaction times from congruent to incongruent stimuli in the Flanker task than controls and that adding a dual-task would slow the performance more in the risk groups than in controls. Methods. The participants (N = 274) in this study were collected from a large longitudinal cohort study of Finnish children with perinatal risk factors and their healthy peers. Those with purely one perinatal risk factor (LBW or HB) and completion of the Flanker task at the 40-year neuropsychological assessment were included in this study. The controls (N = 78) had completed the Flanker task but had no perinatal risk factors. The repeated measures of analyses of variances was used to examine the relationship between risk groups and the Flanker task. Results and conclusions. There were no statistically significant differences between groups in the changes in reaction times from congruent to incongruent stimuli in the Flanker task. However, the LBW group performed overall slower compared to controls. In Dual Flanker task, LBW group’s performance was poorer compared to controls, especially in reaction times to incongruent stimuli, indicating difficulties in cognitive flexibility. In Dual Flanker task, the difference in reaction times from congruent to incongruent stimuli decreased in all groups. There were no differences between HB group and control group. All differences became nonsignificant when general intelligence (FSIQ) was considered. This could be due to the fact that performance in both FSIQ and Flanker task require cognitive flexibility and speed.
  • Kosola, Salla (2021)
    Objectives – Neonatal hyperbilirubinemia (HB), also referred to as neonatal jaundice, can alter child’s neurodevelopment, and thus significantly increase infant’s risk for severe neurological disability. Although the majority of neonatal HB cases benign, there are several cases where bilirubin levels grow alarmingly and remain elevated, eventually causing permanent physical harm and frequently altering the development of central nervous system. Research on the long-term effects of HB has been lacking: the follow-ups have been relative short, and there are not many studies focusing on how neonatal HB might influence neurocognition in later adulthood (> 30 year of age). The aim of this study is to further investigate the association between neonatal HB and later cognitive performance in adulthood by using data from over 40-year-long Finnish follow-up study. Methods – In a longitudinal prospective study, data were collected from 125 subject who had experienced neonatal HB and from 77 controls. Cognitive performance was assessed at age of 40 by using various previously validated methods designed to assess executive function and attention, memory, verbal functions, and visuo-perceptual functions. Four factors were formed for neuropsychological variables: Cognitive flexibility, Visual memory and perception, Verbal memory, and Reading. In addition, all subjects had performed WAIS-IV assessments. Data from these assessments were used to create four new factors – Verbal comprehension, Working Memory, Perceptual Reasoning, and Processing Speed – reflecting different cognitive areas. Also, Full-Scale Intelligence Quotient (FSIQ) was included. Linear regression analyses were used to assess the relation between HB-classification and neuropsychological variables. Differences between the groups were further studied by pair-wise comparisons using t-test, after which Mann–Whitney-U test was used to take into account moderate to highly skewed distributions of the variables. Effects of different HB levels on later neurocognition was studied by using linear regression, where sex, mother’s age at birth, and mother’s education level were controlled. Results – Neonatal HB was associated with slower performance in Cognitive Flexibility, and with lower performance in Perceptual Reasoning and in FSIQ. Highest measured neonatal bilirubin levels within HB group had a linear effect on Verbal Comprehension at age of 40; however, the effect was not found in other cognitive domains. Conclusions – Neonatal HB has effect on performance in FSIQ at age of 40 years. In addition, it was associated with both poorer Perceptual Reasoning and slower Cognitive Flexibility. Results might be due to perceptual reasoning’s high vulnerability to neuronal damage and to difficulty of compensating perceptual biological limitations with learning. Since the measured neonatal bilirubin levels within HB group was associated only with lower performance in Verbal Reasoning in this study, it could be concluded that after reaching the inclusion criteria the excess level of bilirubin was no longer significant influence on severity of the outcome.
  • Björkbom, Emil (2016)
    BACKGROUND: Approximately 10-25 lung transplantations are performed annually in Finland, and one-year survival has been 95 % the last 10 years. 1-3 Our aim was to find associations between perioperative fluid replacement therapy and postoperative patient outcome, with special emphasis on the use of colloids and blood products. MATERIAL AND METHODS: We retrospectively evaluated data from 100 patients who underwent lung transplantation with cardiopulmonary by-pass support in Finland from 2007 to 2013. Outcomes of interest were length of stay in the intensive care unit, hospital stay time, time in ventilator, use of extracorporeal membrane oxygenation (ECMO) postoperatively, postoperative renal replacement therapy, postoperative graft failure, and one-year mortality. RESULTS: 100 patients were studied. 12 patients were on ECMO preoperatively. One-year mortality was 5/100 (5 %) and three-year mortality was 7/100 (7 %). Intraoperative fluid balance was positive (4762±3018 ml), but fell significantly postoperatively, being below +1000 ml on the first postoperative day. During the 2-7 postoperative days net fluid balance continued decreasing and stayed negative. Intraoperative use of hydroxyethyl starch and fresh frozen plasma were significantly higher in non-survived patients than in survivors, p<0.05. Intraoperative use of fresh frozen plasma, but not red blood cells or platelet concentrates, correlated with graft failure, p=0.012. The postoperative use of colloids or blood products did not correlate with mortality or graft failure. Patients who were on ECMO preoperatively, stayed longer on ventilator and their length of stay in the intensive care unit and the hospital ward were longer, p<0.001. 8 patients needed postoperative renal replacement therapy. CONCLUSIONS: Intraoperative use of fresh frozen plasma and hydroxyethyl starch is associated with increased mortality and graft failure. Postoperative use of colloids and red blood cells did not correlate with patients' outcome. Use of ECMO preoperatively resulted in prolonged length of stay.
  • Sahlman, Sara-Sofia (2022)
    Mitochondrial disorders form a heterogenous disorder group with symptoms widely varying. They exist because of mutations in mtDNA or nuclear DNA, which encode mitochondrial proteins or regulate their functions. Because mitochondria are present in almost all cells in the human body, symptoms of mitochondrial disorders vary and can manifest in all tissues. The most common manifestation of mitochondrial disorders in adult patients is mitochondrial myopathy, which leads to muscle weakness and fatigue. Pathological findings of mitochondrial myopathy include changed activities in mitochondrial respiratory chain, centrally located nuclei and increased expressions of genes related to integrated mitochondrial stress responses. One of the neurological symptoms of mitochondrial disorders is parkinsonism. Parkinson’s disease is the world’s second most common neurodegenerative disease. Its clinical symptoms include bradykinesia and resting tremor, and its pathological hallmarks include alphasynuclein protein accumulations and loss of dopaminergic neurons in substantia nigra. Despite being described first time over a hundred years ago, the mechanisms behind Parkinson’s disease are still unclear. However, several genes have been associated with Parkinson’s disease. PINK1, encoding PINK1 protein, and PRKN, encoding Parkin protein, are genes, which mutations have been associated to early onset Parkinson’s disease. According to suggested theories, their normal physiological functions include mediating a special form of autophagy, mitophagy, and suppressing mitochondrial antigen presentation. It has been suggested that loss of PINK1 or PRKN could disrupt mitophagy, leading to accumulation of dysfunctional mitochondria in the cell, disrupting its homeostasis and leading to its death. This PINK1/Parkin-mediated mitophagy and its disruption could explain the death of dopaminergic neurons. In addition, loss of PINK1 and Parkin could also activate mitochondrial antigen presentation, which activates autoimmune response and destroys dopaminergic neurons presenting mitochondrial antigens. This suggests that Parkinson’s disease could have autoimmune-like mechanisms behind it. Together, these theories could explain the onset of Parkinson’s disease when PINK1 or PRKN are absent. In this thesis, the main objective was to study, how loss of PINK1 and PRKN would affect on muscle of aged mouse. More precisely, the effects of these genes to mitochondrial homeostasis were studied in terms of mitophagy and mitochondrial respiratory chain activity. In addition, it was studied, if these genes could induce mitochondrial myopathies or affect to existing condition by studying typical signs associated with mitochondrial myopathy, such as changes in activity of mitochondrial respiratory chain subunits, location of nuclei in muscle, changes in lipid and glycogen accumulation and expressions of genes associated to mitochondrial integrated stress responses. Finally, the theory of mitochondrial antigen presentation was studied. The results of this thesis provide more evidence to theory of PINK1/Parkin mediated mitophagy, but also suggest, that these proteins could be compensated. Based on the results, PINK1 seems to be more crucial for healthy muscle, but in already existing mitochondrial myopathy, loss of either of PINK1 or Parkin seems to improve the condition. According to this thesis, both PINK1 and Parkin, and mitophagy seem to be crucial in induction of mitochondrial myopathy. Despite more evidence is now provided to support the roles of PINK1 and Parkin in mitochondrial maintenance, their roles in mitochondrial antigen presentation did not receive support from this thesis.
  • Kyrylenko, Petro (2016)
    A natural sweetener from Stevia rebaudiana has the potential to reduce calorie intake. Recent data suggest that glycosides from Stevia display favorable pharmacological properties for the metabolic syndrome. Skeletal muscle constitutes a major extrahepatic tissue responsible for glucose utilization. We studied whether steviol can modulate glucose uptake in L6 myocytes. Signaling targets that are central in regulating cellular glucose metabolism were assessed with western blotting. Our data show that the highest concentration of steviol tested decreased slightly and statistically significantly the glucose uptake rate in insulin-stimulated muscle cells. This was supported by western blotting data from targets Akt and GSK-3β. Therefore, our data suggest that direct exposure of myocytes to steviol causes insulin resistance. The results can aid in planning further experiments to understand the pharmacological effects of Stevia-derived products. This would ultimately enhance our understanding of the mechanism behind insulin resistance and be used in future drug development.
  • Sinkko, Matilda (2021)
    In this master’s thesis, in vitro neuromuscular junction (NMJ) model was set up using microfluidic devices. Additionally, the effect of R878H/R878H mutation in MCM3AP gene that causes an early-onset peripheral neuropathy on NMJ formation and maintenance was studied. To study human NMJs that significantly differ from other mammal NMJs is challenging and new models to study the function of these complex and highly specialized structures are needed. Induced pluripotent stem cells (iPSC) and motor neurons were characterized with gene expression studies using qRT-PCR and with immunocytochemistry studies using commonly known markers for pluripotency and motor neurons. NMJs were studied in 2D co-cultures and with microfluidic devices. Gene expression studies were conducted from 2D co-cultures and co-cultures in microfluidic devices provided detailed information of the localization and morphology of NMJs. Expression of essential genes for NMJ formation together with immunocytochemistry results with alpha-bungarotoxin (BTX) staining showed that NMJs were formed in both control and R878H/R878H mutant cell line co-cultures. There was a trend of lower gene expression levels of NMJ essential genes in the R878H/R878H mutant line compared to the control line and also immunocytochemistry results indicated impairment in NMJ formation in the mutant line, but further studies are needed to validate the effect of R878H/R878H mutation on the NMJ formation. In future, functional studies could be conducted to investigate whether these NMJs are functional and the information from the motor neuron terminal is conveyed to the muscle membrane.
  • Vähäaho, Niina (2018)
    Background and objectives: Currently in Finland, there are over 66 000 women living with breast cancer. The five-year survival rate is 90.6 %. Breast cancer and its treatments are known to impair patients’ health-related quality of life (HRQoL). The current study is a part of an open prospective randomized Breast cancer and exercise (BREX) -study in Finland conducted to investigate whether supervised exercise training shortly after the adjuvant treatments of breast cancer patients could prevent osteoporosis and improve patient’s quality of life. This master thesis examines cross-sectional and prospective associations between the sense of coherence (SOC) and the HRQoL of breast cancer survivors. Methods: 537 long-term breast cancer survivors and controls who participated in a prospective randomized physical exercise intervention with twelve months of supervised exercise training were followed up five years. 406 participants who finished the 5-year follow-up and filled the SOC questionnaire were included in the final analyzes. The SOC was measured by 13-item Finnish and Swedish short forms of Orientation to life Questionnaire (SOC-13) at 3 years. Cancer-specific HRQoL was measured by the European Organization for Research and Treatment of Cancer Quality of Life Questionnaire Core 30 (EORTC QLQ-C30) version 3 and general HRQoL by the 15D. Associations between the SOC and the HRQoL were studied by logistic regression analyze. Results and conclusion: The SOC was associated with the cancer-specific and the general HRQoL at the 3-year (p < .001) and at the 5-year follow-up (p < .001). The relationship was the most significant for the general HRQoL, global health / quality of life and emotional and cognitive functions. Weak SOC increases the risk of low cancer-specific and low general HRQoL after the adjuvant treatments of breast cancer. Strong SOC as an inner resource may serve as a protective psychological factor in the adaptation process of breast cancer survivors. The SOC-13 questionnaire might be useful in targeting patients vulnerable to decrease in the HRQoL and in planning psychosocial interventions.
  • Schäfer, Annika (2018)
    ABSTRACT The insular cortex (insula) was recently identified as key neuroanatomical substrate underlying the neurocircuitry of addiction, and a rapidly growing body of evidence ascribe it numerous functional roles in addiction-related behaviours. Yet, neural system interactions through which the insula establishes its roles remain largely unknown. Identifying these critical circuits lays the foundation for the successful advancement of addiction research and therapeutics targeting this brain area. To this end, the current set of experiments aimed to characterize the efferent connections of the anterior insula (AI) to the nucleus accumbens (NAc; AI --> NAc) and the basolateral amygdala (BLA; AI --> BLA); two subcortical regions, which are heavily implicated in reward, motivational and emotional processing. By chemogenetically manipulating the activity of these circuits, their functional roles in modulating alcohol self-administration in alcohol-preferring AA (Alko, Alcohol) rats were examined. While AI --> NAc projections were recently verified anatomically, we first confirmed connectivity of AI --> BLA by injecting a viral retrograde tracer encoding enhanced green fluorescent protein (eGFP) unilaterally into the BLA of AA rats. The functional role of the AI --> BLA and AI --> NAc pathways in mediating alcohol drinking was examined by using the intermittent two-bottle choice paradigm in combination with a Cre-dependent DREADD (Designer Receptor Exclusively Activated by Designer Drug) approach. Projection-specific DREADD expression was achieved by injecting a Cre-dependent viral DREADD vector into the AI while a retrograde virus carrying Cre-recombinase was injected either into the BLA or NAc. CNO-induced activation of the AI --> NAc circuit resulted in a significant increase in alcohol consumption. Curiously, silencing these projections had no effect, either reflecting the intrinsic nature of the NAc circuitry or limitations inherent in the technical approach. Neither chemogenetic silencing nor activation of the AI --> BLA circuit altered alcohol consumption. Furthermore, no changes were observed in the control groups upon systemic CNO administration, indicating no unspecific CNO effects. The current body of work provides new insights into the insula-related circuitry showing that the activity of the AI --> NAc circuit drives alcohol self-administration, whereas AI --> BLA projections are not recruited during this behaviour. This indicates that the insular-striatal circuit belongs to the forebrain neurocircuitry underlying alcohol drinking. The study should be pursued by characterizing the neuronal populations and specific neuronal receptor populations that are involved in the AI --> NAc circuit. Future research should examine other insular-centred circuits that may govern alcohol drinking.
  • Lötjönen, Paula (2017)
    Eisenmengerin oireyhtymän (ES) taustalla on synnynnäinen sydänvika, jossa systeemi- ja keuhkoverenkierto sekoittuvat muodostaen oikovirtauksen, joka kulkee ainakin osittain oikealta vasemmalle. Potilaiden elinikä on yhä alhaisempi kuin terveen väestön, vaikka ennuste on parantunut viime vuosikymmenten aikana. Suomen ES-potilaita ei ole aiemmin tutkittu systemaattisesti. Tämän tutkimuksen tavoitteena oli selvittää ES:n epidemiologiaa Suomessa vuosina 1977-2012. Lisäksi pyrimme tutkimaan potilaiden yleisimpiä kuolinsyitä ja sairastavuutta sekä uusien keuhkoverenpainetta alentavien lääkkeiden (Advanced therapy, AT) käyttöä ja vaikutuksia ES-potilailla. Potilasaineisto kerättiin maanlaajuisesti Terveyden ja hyvinvointilaitoksen (THL) tiedostojen avulla. Tulokset analysoitiin SPSS-tilastointiohjelmalla. Päätetapahtumaksi määritettiin kuolema tai sydän-keuhkosiirteen saaminen. Aineisto käsitti 166 potilasta, joista 67% oli naisia ja 35% Down-potilaita. Yleisimpiä sydänvikoja olivat VSD ja AVSD. Vuoden 2012 lopulla sydän-keuhkosiirteen oli saanut 12 potilasta, 94 oli menehtynyt ja 60 oli elossa. Elossa olevat potilaat olivat keskimäärin 40-vuotiaita. ES:n esiintyvyys ja ilmaantuvuus on laskenut viime vuosikymmenien aikana: vuonna 2012 esiintyvyys oli 11/miljoona asukasta ja 2000-luvulla ilmaantuvuus 0,1/miljoona asukasta/vuosi. Yleisimpiä kuolinsyitä olivat sydämen vajaatoiminta ja infektiot. Suurin osa potilaista kärsi jostain tutkimastamme komplikaatiosta. AT-lääkityksiä oli käyttänyt 36 potilasta ja käytetyimpiä lääkkeitä olivat bosentaani ja sildenafiili. Lääkkeet vaikuttivat hieman parantavan suorituskykyä 6 minuutin kävelytestissä (6MWT) sekä pienentävän sairastavuutta ja kuolleisuutta. Tutkimuksella saatiin uutta tietoa ES-potilaista ja sairauden epidemiologiasta Suomessa. Potilaiden määrä on pienentynyt vuosien aikana ja potilaat voivat aiempaa paremmin. AT-lääkityksillä vaikuttaisi olevan positiivista vaikutusta potilaan elämänlaatuun, sairastavuuteen ja kuolleisuuteen, vaikutuksista tarvitaan kuitenkin lisätutkimuksia.
  • Lapatto, Lauri (2020)
    Ihmisen perintötekijät eli geenit koostuvat eksoneista ja introneista. Eksonit sisältävät ohjeet valkuaisaineiden, proteiinien, valmistamiseksi. Yhden henkilön kaikista eksoneista käytetään yhdessä termiä eksomi. Tämän eksomin rakenne eli emäsjärjestys on nykyisin mahdollista selvittää erityisillä sekvensointilaitteilla. Muutokset tai virheet eksomissa, eli yhdessä tai useammassa eksonissa, voivat johtaa tiettyjen proteiinien puuttumiseen tai muodostumiseen väärin, mikä aiheuttaa sairauden. Tämän vuoksi eksomin rakenteen selvittäminen eli eksomisekvensointi on tullut käyttöön potilaiden diagnostiikkaan. Kyseessä on kuitenkin edelleen niin vaativa ja kallis tutkimus, että sen hyödyntämistä edeltävät usein muut lääketieteelliset tutkimukset. Eksomisekvensoinnin jälkeen vaaditaan vielä saatujen tietojen tulkitsemista suhteessa potilaaseen ja taustaväestöön. Esimerkiksi eräät muutokset eksomissa ovat niin yleisiä tietyissä väestöissä, että voidaan olettaa, etteivät ne aiheuta sairauksia. Eksomin rakenteen selvittämistä voidaan diagnostiikan lisäksi hyödyntää tutkimuksissa etsittäessä uusia, tuntemattomia perimän muutoksia sairauksien tai tautien taustalla. Tässä tutkimuksessa kolmen potilaan eksomisekvensointituloksista suodatettiin populaatiotietoja sekä kyseisten potilaiden kliinistä kuvaa hyödyntäen todennäköiset kandidaattigeenit. Saatujen kandidaattigeenien avulla voidaan diagnostiikkaa kohdistaa tarkemmin esimerkiksi tiettyyn aineenvaihduntareittiin. Eksomisekvensointia voidaan luontevasti verrata koko perimän eli genomin sekvensointiin tai ennalta valikoituun geenijoukkoon kohdistuvaan paneelisekvensointiin. Koko genomiin nähden on eksomin tutkiminen selkeästi nopeampaa ja halvempaa. Toisaalta osa sairauksista johtuu muutoksista eksonien ulkopuolissa alueissa, joiden havaitsemiseen genomisekvensointi soveltuu. Paneeleita käytettäessä on etukäteen tiedettävä, mihin geeneihin paneeli kohdistetaan. Tällöin ei myöskään löydetä mahdollisia uusia tauteja aiheuttavia perimän muutoksia.
  • Aaltio, Juho (2019)
    Tausta: DNA:n sekvensointitekniikoiden kehitys mahdollistaa yhä useammin harvinaista perinnöllistä sairautta sairastavan potilaan molekyyligeneettisen diagnoosin löytämisen. Uuden sukupolven sekvensointitekniikoista etenkin koko geenistön analyysiä eli eksomisekvensointia on alettu käyttää yleisesti suurien potilaskohorttien taudinaiheuttajamutaatioiden löytämiseen. Suomessa perinnöllisten sairauksien diagnostiikka keskittyy edelleen erilaisten geenitestien ja –paneelien käyttämiseen kliinisen epäilyn perusteella. Eksomisekvensoinnilla voidaan arvioida yhdellä kertaa potilaan kaikkia proteiinia koodaavia geenin alueita mutaation löytämiseksi. Tavoitteet ja menetelmät: Tutkiaksemme eksomidiagnostiikan merkitystä perinnöllisten sairauksien diagnostiikassa, teimme prospektiivisesti eksomisekvensoinnin 48:lle vaikeaa aivosairautta sairastavalle lapselle, ja vertailimme retrospektiivisesti 48:n kontrollipotilaan sairauskertomustietoja selvittääksemme, onko alkuvaiheen eksomisekvensointi parempi vaihtoehto harvinaisten aivosairauksien diagnostiikassa lapsilla. Tulokset: Eksomikohortista 18/48 (37,5%) potilaista sai diagnoosin eksomisekvensoinnilla, kontrollikohortissa muulla kuin eksomisekvensoinnilla diagnoosin sai 10/48 (20,8%). Kontrollikohortista 10 potilasta päätyi myöhäisessä vaiheessa eksomisekvensointiin, jolloin 5/48 (10,4%) sai diagnoosin. Ero eksomisekvensoinnilla ja muulla kuin eksomisekvensoinnilla saatujen diagnoosien (37,5%, 20,8%) välillä ei ollut tilastollisesti merkitsevä (p=0,072). Diagnoosiin kuluvassa ajassa eksomikohortissa diagnoosi saatiin keskimäärin 2,8 vuodessa, kontrollikohortissa 4,0 vuodessa (n=18, n=15). Ero ajassa diagnoosiin ei ollut tilastollisesti merkitsevä (p=0,401). Eksomikohortin potilaista 3 geenidiagnoosia mahdollisti hoitokokeilun aloittamisen. Pohdinta: Tutkimuksellamme saimme eron diagnostiikassa kohorttien välille, vaikka ero ei ollutkaan tilastollisesti merkitsevä. Tuloksessa on pidettävä mielessä, että monet eksomisekvensoinnilla saaduista geenidiagnooseista eivät olisi olleet sairaaladiagnostiikassa käytettävillä geenitesteillä mahdollisia. Tutkimuksemme jatkuu eksomidiagnostiikan kustannustehokkuuden tutkimisella, jolloin selvitämme kohorttien välisiä kustannuksia diagnostisissa selvittelyissä.
  • Sihvonen, Mikko (2021)
    Mycobacterium tuberculosiksen aiheuttama tuberkuloosi on yksi yleisimmistä kuolemaan johtavista sairauksista kehitysmaissa. M. tuberculosis-bakteerin tiedetään kykenevän väistämään potilaan immuunipuolustusta ja hyödyntämään makrofagien sekä muiden puolustussolujen ominaisuuksia. M. tuberculosis kykenee lisääntymään makrofagien sisällä. Eksosomit ovat solunulkoisia rakkuloita, joita kaikki solut erittävät. Eksosomeilla tiedetään olevan myös immunomodulatorisia vaikutuksia. Tutkimuksen tarkoituksena oli kehittää in vivo-malli eksosomien immunomodulatoristen ominaisuuksien mallintamiseen seeprakaloissa, hyödyntämällä seeprakalojen omaa Mycobacterium marinum-patogeeniä. Tutkimuksessa käytettiin ihmisen monosyyttilinjan soluja (THP-1), lämpötapettuja M. marinum-bakteereja ja seeprakalojen poikasia. THP-1 -soluja käsiteltiin lämpötapetuilla M. marinum bakteereilla viidellä eri bakteerikonsentraatiolla. Lisäksi tutkimuksessa oli yksi bakteereilla käsittelemätön THP-1 -soluviljelmä. Kaikista THP-1 -soluviljelmistä eristettiin ultrasentrifugaatiolla kyseisten solujen tuottamia eksosomeja. Eristettyä eksosomeja mikroinjektoitiin kuorittujen seeprakalan poikasten ruskuaispussin blood circulation valley -suoneen, jotta nähtäisiin aiheuttavatko ne muutoksia kalojen tulehduksenvälittäjäaineiden geenien ilmentymisessä eli geeniekspressiossa. Noin puolen vuorokauden jälkeen kalaryhmästä poistettiin kuolleet yksilöt ja elossa olevat kerättiin talteen RNA-eristystä varten. Eristetty RNA käännettiin DNA:ksi ja reaaliaikaisella polymeraasiketjureaktiolla, qPCR:llä, mitattiin kohdegeenien ekspressioita. Tutkimuksessa havaittiin valittujen tulehdusvälittäjäaineiden geenien ilmentymisen lisääntymistä seeprakaloissa. Geenin ilmentymstaso oli sitä suurempi, mitä suuremmalle bakteerimäärälle THP-1 -solut oli altistettu ennen eksosomien eristystä. Kaikkein korkeimmat tulehdusvälittäjäaineiden geeniekspressiotasot nähtiin altistamattomien solujen eksosomeilla injektoitujen kalojen ryhmissä. Kontrolliksi valitussa geenissä ei havaittu vastaavaa geeniekspression kasvua. Näiden tutkimustulosten perusteella lämpötapetulla M. marinumilla käsiteltyjen THP-1 -solujen eksosomeilla näyttäisi olevan kyky aiheuttaa samankaltaisia muutoksia tulehdusvälittäjäaineiden geeniekspressiossa kuin seeprakalojen suoralla M. marinum infektiolla. Tulosten vahvistamiseen tarvitaan vielä lisätutkimuksia.
  • Jansson, Maarit (2019)
    Objectives. The objective of this study was to investigate the relationship between physical and cognitive activity at different eras (young adulthood, middle age, old age) and subjective and objective cognitive functioning in elderly subjects. In addition, the change of physical and cognitive activity over time and the relationship of the activities crosswise and longitudinally were investigated. Methods. Subjects (n = 73) were healthy seniors aged 60 years or older. Level of activity at different eras of life and subjective cognitive functioning were mapped using self-report questionnaires. Objective cognitive functioning was assessed using standardized neuropsychological tests. Data was analysed statistically with correlation analyses, regression models and repeated-measures analyses of variance. Results and Conclusions. Cognitive activity especially in young adulthood was associated with better objective cognitive functioning in elderly participants. Surprisingly, the association between cognitive functioning and physical activity in young adulthood and older age was negative. Lifetime activity did not affect subjective cognitive functioning. The level of cognitive activity was highest in young adulthood and affected the activity level later in life. The level of physical activity decreased with age only indicatively. Physical and cognitive activity levels were not associated either in in cross-sectional or longitudinal analyses.
  • Yrttiaho, Janica (2017)
    Objectives. Can individual differences in the way people manage their own lives (life management) be explained from the perspective of life history theory? Understanding these differences is important since life management has a great impact on the wellbeing of people. Life history theory has already been proven to explain many individual differences in the human cognition; this study aimed to expand this field of knowledge. Life history theory states, that the early-life environment of an individual shapes her life history strategies, adapting her to her environment. The events that serve as reminders of mortality in the environment of an individual (mortality cues) were hypothesised to activate different life history strategies in individuals with different childhood environments. This was hypothesised to be reflected as differences in life management. The study also sought to find out, if the observation that people can react differently to a similar mortality cue can be explained by their strategy's impact on their locus of control. Methods. The data used in this study came from the Cardiovascular Risk in Young Finns Study. The relationship between early-life environment (childhood socioeconomic status, SES) and life management (the Self-directedness scale in the Temperament and Character Inventory and two items concerning coping) was explored in the study. Regression analysis was used to analyse whether mortality cues moderated the relationship between SES and self-directedness. Logistic regression analysis was used to analyse whether they moderated the relationship between SES and coping. Sample size was 2 103 for analyses concerning self-directedness (mean age = 31.48 years) and 773 for those concerning coping (mean age = 20.66 years). Results and conclusions. Individuals with lower childhood SES felt that things outside their control were influencing their life more than did those with higher childhood SES. Lower SES was also connected with lower self-directedness in general. The tendency to use one way of coping over another after facing the death of a friend or a family member seemed to depend on childhood SES. Individuals with lower childhood SES used more approach coping; those with higher childhood SES used more avoidance coping. Life history theory seems to be a relevant scientific framework for studying individual differences in life management. Differences in life management might help to understand why people with different backgrounds might react differently to a similar mortality cue. However, no interaction effect on life management was found between the other mortality cues used in the study and childhood SES. Sporadic incidences that are a natural part of life do not seem to activate life history strategies permanently. It is advised then, that especially when the activation of life history strategies is explored using an experimental study design, the results should be interpreted keeping in mind the possibility that single cues might only activate strategies temporarily.
  • Kovala-Viita, Minna (2019)
    Tutkimuksen tarkoitus: Korkeakouluopiskelijoiden hyvinvoinnin haasteisiin on viime vuosina kiinnitetty lisääntyvästi huomiota. Tässä tutkimuksessa tarkasteltiin opiskelijoiden hyvinvoinnin tukemista kognitiivis-behavioraalisen Elämäntaitokurssi-intervention avulla. Erityisesti tarkasteltiin intervention vaikutusta osallistujien elämään tyytyväisyyteen ja minäpystyvyyteen. Lisäksi oltiin kiinnostuneita siitä, välittääkö minäpystyvyyden muutos mahdollisia muutoksia elämään tyytyväisyydessä. Menetelmät: Aineisto on kerätty vuosina 2012 - 16 Nyyti ry:n tutkimushankkeessa Opiskelijoiden hyvinvointi ja Elämäntaitokurssi. Tutkimuksessa oli mukana 189 opiskelijaa pääkaupunkiseudun korkeakouluista. Osallistujat satunnaistettiin arpomalla kontrolliryhmään ja interventioryhmään, joka osallistui kuusi viikkoa kestävälle ryhmämuotoiselle Elämäntaitokurssille. Kurssin tavoitteena on tukea osallistujien elämänhallinnan ja mielen hyvinvoinnin taitoja. Tutkimukseen osallistujien elämään tyytyväisyyttä ja minäpystyvyyttä arvioitiin tutkimuksen alkaessa, intervention jälkeen sekä kuusi kuukautta intervention päättymisen jälkeen. Arviointimenetelminä käytettiin Elämään tyytyväisyyden mittaria (SWLS) sekä tätä tutkimusta varten luotua Minäpystyvyysasteikkoa. Tulosten analysoimisessa käytettiin toistomittausten varianssianalyysia sekä mediaatioanalyysia. Tulokset: Elämään tyytyväisyydessä ei välittömästi intervention jälkeen havaittu ryhmien välisiä eroja, mutta kuuden kuukauden seurannassa interventioryhmän elämään tyytyväisyys oli kontrolliryhmää korkeampaa. Minäpystyvyydessä ei havaittu ryhmien välisiä eroja välittömästi intervention jälkeen tai kuuden kuukauden seurannassa. Elämäntaitokurssille osallistuneiden minäpystyvyyden havaittiin kuitenkin intervention kuluessa lisääntyneen, mitä ei tapahtunut kontrolliryhmän sisällä. Minäpystyvyyden ei tässä tutkimuksessa havaittu välittävän elämään tyytyväisyydessä tapahtunutta muutosta. Johtopäätös: Tutkimuksessa havaittiin, että Elämäntaitokurssilla oli joitain positiivisia vaikutuksia osallistujien hyvinvointiin. Tarvitaan kuitenkin lisää tutkimusta esimerkiksi siitä, miten lyhytinterventioiden vaikuttavuutta voitaisiin parantaa ja ketkä niistä parhaiten hyötyvät. Vaikuttavien interventioiden kehittäminen vaatii pitkäjänteistä kehitys- ja tutkimustyötä.
  • Hyytiäinen, Lauri-Eemil (2020)
    Johdanto Tämän tutkielman tavoitteena oli selvittää nuorten aikuisten terveydellisen ja sosiodemografisen elämäntilanteen yhteyttä ajankohtaiseen psyykkiseen kuormitukseen. Terveydellisen elämäntilanteen osalta tarkastelimme koettua terveyttä, elämäntyytyväisyyttä, tyytyväisyyttä parisuhteeseen sekä alkoholin haitallista käyttöä. Sosiodemografisista tekijöistä tarkastelukohteinamme olivat sukupuoli, koulutustaso, työttömyys sekä asuinpaikan koko. Psyykkistä kuormitusta mitattiin GHQ-12 -kyselyllä. Aineisto ja menetelmät Aineistonamme oli kansallinen kaksosten ja heidän perheidensä terveydentilaa ja terveyskäyttäytymistä kartoittava pitkittäinen syntymäkohorttitutkimus (FinnTwin16), joka käsittää vuosina 1975-1979 syntyneet suomalaiset kaksoset. Tässä tutkimuksessa keskityimme FinnTwin16 -tutkimusaineiston osaan, joka kerättin kyselylomakkeella kaksosten ollessa 22-27 vuoden iässä. Kyselylomakkeen osista keskityimme koettua terveyttä, elämäntyytyväisyyttä, parisuhteessa koettua tyytyväisyyttä, alkoholin haitallista käyttöä, työttömyyttä, koulutustasoa ja asuinpaikan kokoa käsitteleviin osiin. Tulokset Havaitsimme, että hyvä koettu terveys, elämäntyytyväisyys ja tyytyväisyys parisuhteeseen olivat kaikki käänteisesti yhteydessä psyykkiseen kuormitukseen sekä miehillä että naisilla. Alkoholin haitallinen käyttö puolestaan oli suoraan yhteydessä psyykkiseen kuormitukseen kaikilla tutkittavilla. Havaitsimme myös, että naisilla psyykkinen kuormitus oli yleisesti ottaen suurempaa kuin miehillä. Työttömyys puolestaan oli yhteydessä suurempaan psyykkiseen kuormitukseen ainoastaan miehillä. Koulutustasolla ja asuinpaikan koolla emme tässä tutkimuksessa havainneet yhteyttä psyykkiseen kuormitukseen. Pohdinta Tässä tutkimuksessa teimme analyysit muuttujakohtaisesti ja poikkileikkausasetelmassa. Jatkossa useamman muuttujan käsittävät analyysit tai psyykkisen kuormituksen tarkastelu demografisesti vakioiduin osajoukoin olisi tärkeää ilmiöiden tarkempien ajallisten yhteyksien ymmärtämiseksi.
  • Mahlamäki, Kasper (2019)
    Syöpätautien yleisyys lisääntyy kaikkialla maailmassa väestön vanhetessa ja Suomessakin todetaan vuosittain noin 35 000 uutta syöpää, joihin kuolee noin 13 000 henkeä. Syövän lääkehoidon painopiste on siirtymässä laajalti elimistön soluja tuhoavista sädehoidosta ja solunsalpaajista kohti potilaan omaa immuunipuolustusta syöpää vastaan ohjaavia immuno-onkologisia lääkkeitä. Immuno-onkologisilla lääkkeillä, kuten tarkastuspiste-estäjiin kuuluvilla PD-1-vasta-aineilla on saavutettu jopa pysyviä remissioita useassa vaikeahoitoisessa syövässä. Valitettavasti vain pieni osa immunologisilla syöpälääkkeillä hoidetuista potilaista saa niiden täyden hyödyn ja hoitovasteen laajentaminen koko potilasjoukkoon on osoittautunut ongelmalliseksi. Tutkielmani kirjallisuuskatsauksessa käsitellään rintasyöpää yleisesti, sekä syvennytään rintasyövän prekliinisiin tutkimusmalleihin ja rintasyöpäpotilaan immuno-onkologiavasteen ennustetekijöihin. Kokeellisen laboratoriotutkimusosuuden tavoitteina oli korreloida rintasyöpänäytteiden leukosyytti-infiltraation taso kasvaimen Myc- ja PD-L1-ekspressioon, mitata solulinjojen ja tutkimusryhmämme kehittämien PDEC-eksplanttien immuuniaktivaatiota, sekä arvioida näiden tutkimusten tulosten avulla rintasyöpäpotilaan kasvainnäytteestä kasvattamiemme PDEC-kudosviljelmien potentiaalia rintasyövän immuno-onkologisessa tutkimuksessa. Löysin tutkimalla primäärikasvainten ja PDEC-eksplanttien ominaisuuksia immunohistokemialla sekä qRT-PCR:llä korrelaation primäärikasvaimen leukosyyttimäärän sekä PDEC-viljelmien qRT-PCR:llä mitatun immuuniaktiivisuuden välille: kasvaimen korkea leukosyyttipitoisuus vaikuttaa olevan yhteydessä PDEC-viljelmien suurempaan immuuniaktiivisuuteen. Mielenkiintoista oli havaita, että vaikka immuunisolujen aktivoimiseen käytetyn Immunocultin tulisi aktivoida kaikkia T-soluja, niin edes runsas kasvaimen strooman leukosyytti-infiltraatio ei aiheuttanut qRT-PCR:llä tehdyissä immuuniaktivaatiomittauksissa menetelmän käyttöä häiritseviä vääriä positiivisia tuloksia. Tulosteni perusteella PDEC-eksplantit kykenevät kuvaamaan rintasyöpäpotilaiden kasvainkohtaisia immuuniaktivaatioeroja, mikä korostaa niiden soveltuvuutta immuno-onkologiseen tutkimukseen.
  • Väntänen, Jani (2018)
    Objectives. Perception of auditory pitch can be divided in to two dimensions of height and chroma. Tones of the same chroma, one or more octave intervals apart, sound similar. The octave interval is defined as the doubling of a tones fundamental frequency. However, in humans the perceptual octave slightly exceeds its mathematical counterpart. The objective of this study was to clarify the neural underpinnings responsible for the subjective experience of chroma and the enlarged octave. Methods. During all experiments adapter tones followed by probing tones were sequentially presented to participants (n=18). Adapter tones were used to activate neural populations and probing tones were used for measuring amplitude reductions (adaptation) in EEG derived event related potentials (ERPs) signalling overlapping neural population responses to adapter and probing tones. Participants were divided in to two groups with either sine tones or complex tones as adapters. 7 pitch separations between adapter and probe were used. Differences between different interval ERPs and effects of musical proficiency in both groups were analysed with mixed repeated measures analyses of variance. Measurements were fitted to a combined sinusoidal and linear pitch helix function. Source magnitude estimation was calculated to investigate hemispheric asymmetry. Results and conclusions. There was greater neural overlap between tones sharing the same chroma compared to tones one semitone apart. Periodicity independent adaptation indicated that pitch is not co-represented with stimulus spectrum in the human auditory cortex. Source magnitude analyses showed that N1 responses were stronger on the right auditory cortex. P2 amplitude showed stronger adaptation to enlarged octave intervals in comparison to exact mathematical octave intervals.
  • Henriksson, Joanna (2022)
    Background: Aphasia changes one’s communication. The most common symptoms of aphasia include difficulties finding words. When a person acquires aphasia, they often need to learn new ways to communicate to support themselves when their speech is impaired. Gestures are a common way to aid communication in people with aphasia. Purpose: In this Master’s Thesis we look at the use of gaze and hand gestures in people with aphasia during word retrieval. The goal of this study is to find out which types of gesture are used and how the gestures are timed. Methods: This study was completed under the COMPAIR project. COMPAIR is a research program that focuses on atypical communication. The annotation program ELAN and an annotation template used by the COMPAIR project were utilized in this study. The material for this study consisted of everyday conversations between four people with aphasia and people close to them. There was also video material where one of the participants performed on Boston Naming Test. There were four participants in this study. Half (n=2) of them presented with fluent aphasia and the other half (n=2) with non-fluent aphasia. The total duration of the taped conversations was 144 minutes. Results: The participants of this study showed varying amounts and types of gesture. Every participant had a type of gesture that was the most typical for them. Most used gestures were descriptive and pointing gestures, gaze shift during word retrieval and touching own body. Most of the use of gesture happened during the word retrieval phase where the participants attempted to find the missing word and made several initiations to repair their speech. Conclusions: People with aphasia have unique ways of using gestures in their communication and therefore it is not possible to draw definite conclusions of general rules of gesture use in aphasia from a sample size this small. However, all of the participants used some type of gesture in support of their word retrieval so it seems that gaze and hand gestures can an important mean to aid impaired communication.