Skip to main content
Login | Suomeksi | På svenska | In English

Browsing by Title

Sort by: Order: Results:

  • Ven, Katharina (2019)
    Lipid droplets (LDs) are ubiquitous intracellular storage organelles, consisting of a core of energy rich neutral lipids surrounded by a phospholipid monolayer. Research in the past decade has expanded the view on LDs from simple, passive cytosolic inclusions to dynamic organelles which play an important role in many cellular processes. Furthermore, there is mounting evidence for links between LD biology and human pathologies, such as metabolic disorders, non-alcoholic fatty liver disease and cardiovascular diseases. Thus, understanding the basic biology of LD formation is crucial. LD biogenesis is thought to occur in the microdomains of endoplasmic reticulum (ER), due to the accumulation of neutral lipids between the two leaflets of the ER bilayer before budding into the cytosol. Many proteins are involved in this early formation, but no single indispensable protein has been discovered. After assembly, these early LDs grow through lipid deposition from the ER, and with lipid synthesis on the droplet monolayer. During LD growth, LDs are thought to retain connection to the ER. A protein important for LD biogenesis is seipin. This oligomeric ER protein has been found to localize at contact sites between the ER and LDs. Mutations in seipin give rise to three distinct diseases in humans; BSCL2, seipinopathy and Celia’s encephalopathy. The role of seipin in the formation of LDs and the pathogenesis of these diseases is still unknown. Work from numerous model systems has shown seipin to be important for LD biogenesis and adipocyte differentiation. LD formation is a complex process which is still poorly understood, and seipin likely collaborates with other proteins during LD assembly. In this thesis, APEX2-mediated proteome mapping combined with LC-MS/MS, is set up to identify proteins involved in LD biogenesis. In this technology, an engineered ascorbate peroxidase, APEX2, is genetically inserted to the intracellular region of interest where it rapidly biotinylates nearby endogenous proteins upon exposure to biotin-phenol and hydrogen peroxide. Biotinylated proteins can then be enriched by using streptavidin beads and identified with a mass spectrometry. The aim using this technology is to unravel new interaction partners of seipin and proteins important for LD formation, which is a crucial step for understanding LD formation and diseases related to it.
  • Saukkonen, Tuulia (2022)
    Tavoitteet. Suomalaisten nuorten mielenterveys on viime vuosina heikentynyt ja on tärkeää etsiä keinoja nuorten hyvinvoinnin tukemiseen. Uskonnollisuus on monissa tutkimuksissa maailmalla ennustanut parempaa mielenterveyttä. Tässä tutkimuksessa haluttiin selvittää, onko uskonnollisuus yhteydessä mielenterveyteen myös suomalaisilla nuorilla. Tutkimuksen hypoteesina suuremman uskonnollisuuden oletettiin ennustavan parempaa hyvinvointia. Lisäksi tutkimuksessa tarkasteltiin yhteydessä mahdollisesti esiintyviä sukupuolieroja, koska sukupuolten välillä on aiemmissa tutkimuksissa havaittu toistuvia eroja sekä mielenterveydessä, että uskonnollisuudessa. Menetelmät. Tutkimuksen aineisto koostui 15-16-vuotiaiden nuorten vastauksista Helsingin yliopiston teettämään vuoden 2020 nuorisorikollisuuskyselyyn. Uskonnollisuuden yhteyttä prososiaaliseen käyttäytymiseen, tunne-elämän oireisiin, käytösongelmiin, yliaktiivisuuden/tarkkaamattomuuden oireisiin ja vertaissuhteissa ilmeneviin ongelmiin tutkittiin yleisillä lineaarisilla malleilla. Tulokset ja johtopäätökset. Tutkimuksen hypoteesi toteutui osittain, koska suurempi uskonnollisuus ennusti tutkimuksessa tietyiltä osin parempaa hyvinvointia. Se ennusti sukupuolesta riippumatta suurempaa prososiaalista käyttäytymistä. Tytöillä suurempi uskonnollisuus ennusti myös vähäisempiä mielenterveyden ongelmia. Pojilla suurempi uskonnollisuus sen sijaan ennusti suurempia tunne-elämän oireita antaen viitteitä sukupuolen vaikutuksesta uskonnollisuuden ja hyvinvoinnin väliseen yhteyteen. Mahdolliset sukupuolierot on tärkeää ottaa huomioon tulevaisuuden tutkimuksissa ja miettiessä keinoa tukea nuorten hyvinvointia.
  • Takkunen, Laura (2019)
    Objectives. In Western Countries, like Finland, religiosity has simultaneously changed and declined. Respectively, nonbeliever identities have increased, but they haven’t received much research attention. Comparisons between believers and nonbelievers have been popular in the past research, and they’ve revealed differences in religious attitudes, intuitive and analytical thinking styles and ontological confusions. The aim of this research was to examine if those factors contribute to differences between groups formed based on nonbeliever identities. Believers were included to the study as a reference category. Methods. The data was collected as a part of the Uncovering the Hidden Nature of Unbelief research project. It consisted of 2112 adult Finns (age 18 to 84) who attended a survey. Religious and nonreligious identities were assessed by asking subjects to choose an option they felt most affiliated. Ontological confusions were assessed by the shortened version of the Core Knowledge Confusions scale, and thinking styles with the shortened version of Rational Experimental Inventory (REI). Two other Likert-scales were used to assess Belief to God and religious attitudes. Differences between the identity groups and factors contributing to them were analyzed by multivariate analysis of anova and discriminant analysis. Results and discussion. Most of the participants identified as atheists or agnostics. Differences between identity groups were detected in all of the factors examined: belief to god, religious attitudes, thinking styles and ontological confusions. Based on these differences, the participants were divided into four groups. A combination of belief to god, religious attitudes and intuitive thinking style formed a factor contributing to most differences between these groups. The results indicate that nonbelievers compose perhaps a more heterogenous group than assumed earlier, also when cognitive factors are taken into acknowledge. This is something to be taken into account in further studies.
  • Vuorikko, Salla (2018)
    Objectives An unbeliever is someone who doesn’t believe in God or gods. There are a lot of unbelievers in the World, especially in Europe. However, the scientific understanding of unbelief is limited. There is little research on different kinds of unbelievers. This study began to explore ritual atheists. Ritual atheists are unbelievers who find some religious rituals meaningful in their lives. The study explored conservative and liberal attitudes of unbelievers, ritual atheists and religious people. It was hypothesized that unbelievers are more liberal than ritual atheists and ritual atheists are more liberal than religious people. Methods The participants were from the 2008 EVS (European Values Study) data, which was collected from 45 different European countries. New variables were computed from the original items, and they represented attitudes concerning morals, family life, tolerance, immigrants and requirements of national identity. Most of the variables were computed by arithmetic means or by using factor analysis. The data was analyzed by multivariate and univariate analysis of variance, by t tests and by discriminant analysis. Results and conclusions With most of the attitudes, unbelievers were more liberal than ritual atheists who, for their part, were more liberal than religious people. This study provided entirely new information about the attitudes of ritual atheists. The results support the assumption that ritual atheism is a unique form of unbelief: a ritual atheist adopts some of the religious influences of the culture, without being religious.
  • Holstein, Ria (2022)
    Artikkelin abstrakti: Introduction: Risk stratification in the emergency departments (EDs) is in critical need for new applications due to ED overcrowding and hospitalization of older people. We aimed to evaluate the expediency, efficiency and safety of a prognostic biomarker, soluble urokinase plasminogen activator receptor (suPAR), as a tool for the risk assessment of patients arriving at the ED. Methods: We performed a comparative cross-sectional study in two emergency departments (EDs), suPAR measurements being incorporated into routine blood sampling in the intervention ED. The primary outcome was the number of discharges from the ED. The importance of the outcomes was examined by appropriate multi- or bivariate analysis. Results: The absolute and relative number of discharges were similar between the intervention and control groups [121 (55,3%) vs 62 (55,9%)]. No significant differences between the groups were seen in the length of stays in the ED. Patients with low suPAR values were more likely discharged and patients with high suPAR values more likely admitted to hospital. Two admitted patients with low suPAR values could have been discharged safely. Conclusion: The utilization of suPAR did not increase the risk for neither positive nor negative outcomes. Low suPAR values could be potential in discharging more patients safely. Instead of unselected patient populations, the benefits of suPAR measurements in the ED could emerge in the assessment of a more precisely determined and selected group of patients.
  • Viitala, Emma Wilhelmiina (2022)
    The gastrointestinal (GI) epithelium is composed of a single layer of cells with a turnover time of only a few days. Due to its location at the barrier between GI tract contents and the underlaying mucosa, the epithelium is constantly exposed to stress such as toxic agents and a variety of pathogens and susceptible to injury. Accordingly, the homeostatic growth as well as repair of injury in epithelium must be efficient and strictly regulated. Misregulated repair of the injured epithelium can lead to pathologies such as chronic inflammation or cancer. Underlying stromal cells such as fibroblasts provide growth factors and other signaling molecules regulating the epithelial cell stemness, differentiation and repair, but the stromal regulatory pathways during regeneration are poorly understood. The aim of this study was to establish a consensus view on the heterogeneity of GI fibroblasts, as well as to map potential epithelium derived signals affecting fibroblast function in homeostatic and injury situations using literature review, in silico approaches, and murine primary intestinal fibroblast culture. Seurat and CellChat R packages were used to perform integration and interaction analyses of six previously published mouse and three human single- cell RNA-sequencing datasets of colonic epithelial and mesenchymal cells isolated in homeostatic and/or inflammatory conditions. Murine primary intestinal fibroblasts were treated with identified potential signaling factors ex vivo and 3’RNAseq was performed to identify transcriptional responses. Both mesenchymal and epithelial cell clusters were identified in the scRNAseq data. Interestingly, similar fibroblast populations could be found in the murine and human data. I identified several epithelium-derived signaling molecules potentially targeting GI fibroblasts and focused on Gas6-Axl pathway and lactate. I confirmed high and specific expression of the Gas6 receptor Axl in intestinal fibroblasts, but recombinant Gas6 failed to induce significant changes in cultured primary fibroblasts. Lactate-treated primary intestinal fibroblasts reprogrammed their transcriptome with main alterations in metabolic pathways and induction of neutrophil-attracting chemokines. In this work I suggest a consensus model for GI fibroblast subpopulations and suggest epithelium derived lactate as a powerful means to reprogram fibroblasts.
  • Ahlmark, Jenna (2012)
    Undersökningens syfte var att utreda hur återupplivningsverksamheten ser ut på de fyra kretssjukhus som tillhör HNS men inte HUCS. Sjukhusen har alla operativ verksamhet och ett sammanlagt befolkningsunderlag på över 400000 invånare. Målet var att utreda hur återupplivningen är organiserad, hur återupplivningsskolning genomförs samt hur återupplivningsresultat samlas in. Liknande studier har inte tidigare gjorts på regionalnivå. Svarsprocenten på den elektroniska enkät som skickades till sjukhusens återupplivningsansvariga läkare och sköterska med ansvar återupplivningsskolning steg till 100 %. Resultaten visar att man idag följer Gängse vård-instruktionerna bättre än tidigare. Idag finns det skötare med ansvar för återupplivningsskolning och läkare med återupplivningsansvar på alla sjukhus. Frekvensen av återupplivningsskolning är fortfarande lägre än rekommenderat, men högre än tidigare. 75 % av sjukhusen har en MET-grupp. Alla sjukhus använder inte HNS officiella återupplivningsblankett och rapporteringen görs inte enligt Utstein-modellen. Undersökningen lyfter fram så väl brister som styrkor i återupplivningsverksamheten. Men med denna kunskap möjliggörs skräddarsydd utveckling av återupplivningsverksamheten på sjukhusen.
  • Östman, Robert (2019)
    Ornitin dekarboxylas antizym-inhibitorer (AZIN) är protein som reglerar polyaminsyntesen. Två AZIN proteiner är kända hos människan (AZIN1/AZIN2). Polyaminer fungerar på flera olika sätt vid cellens proliferation, vilket har lett till stort intresse för deras roll inom neoplastiska förändringar. AZIN1 har betydelse för cellens proliferation, medan AZIN2 har visats ha en större roll vid cellulär vesikeltransport. AZIN2 har ett högt uttryck i sekretoriska celler, bland annat i broskvävnad. Studiens målsättning är att undersöka AZIN2 uttrycket i benigna och maligna neoplasier av brosk. Syftet är att utreda huruvida uttrycket av AZIN2 varierar mellan olika graderna av malignitet. Ifall betydande skillnad finns kunde detta komma till användning vid graderingen av neoplasier för bedömningen av malignitet. Uttrycket av AZIN2 undersöktes med immunohistokemiska färgningar av preparat insamlade från patienter som blivit opererade för kondrom eller kondrosarkom. Studien visar att uttrycket av AZIN2 sjunker vid stigande grad av malignitet (p=0.039). Den visar också att expressionen signifikant sjunker om tumören klassats som benign/lågmalign/högmalign (p=0,016) eller lågmalign/högmalign (p=0,004). Resultaten visar att tumörens uttryck av AZIN2 sjunker vid stigande grad av malignitet. De bekräftar även tidigare fynd av AZIN2:s roll för vesikel transport i cellen.
  • Lindroos, Ada (2022)
    Tutkimuksen tarkoitus: Tarkoituksena oli tehdä kirjallisuuskatsaus Hodgkinin lymfoomasta, jossa tauti ja sen hoitovaihtoehdot kuvataan pääpiirteisesti. Lisäksi viime vuosina HUS syöpäkeskuksessa Hodgkinin lymfooman uusilla biologisilla lääkkeillä brentuksimabivedotiinilla (BV) tai programmed death ligandi 1(PD1) -estäjillä hoidetuista potilaista tehtiin analyysi, jonka tavoitteena oli kartoittaa näiden lääkkeiden tehoa ja haittoja lymfooman hoidossa. Materiaalit ja menetelmät: Kirjallisuuskatsausta varten etsittiin PubMedistä aiheeseen liittyviä artikkeleita, käyttäen esimerkiksi hakusanoja ”Hodgkin lymphoma”, ”brentuximabvedotin” ja ”PD1-inhibitor”. Analyysia varten kerätty aineisto koostuu HUS Syöpäkeskuksessa vuosien 2016 ja 2019 välillä brentuksimabivedotiini tai PD1- estäjähoitoa saaneista potilaista. Potilastietoja kerättiin sähköisistä hoitokertomuksista. Aineiston perusteella laskettiin BV- ja PD1-estäjälääkkeiden hoitovasteen kesto ennen syövän uusimista sekä kokonaiselossaoloaika. Lisäksi kerättiin ylös tieto hoitokertomukseen potilaiden raportoimista hoitojen haittavaikutuksista. Tulokset: Potilaista (N=11) noin puolet oli naisia ja puolet miehiä. Sairastumisen mediaani-ikä oli 23 vuotta. Diagnoosihetkellä syöpä oli paikallinen yhdellä ja levinnyt kymmenellä potilaalla. Kaikki aineiston potilaat saivat jossain kohtaa PD1-estäjähoitoa, yhdeksän potilasta sai lisäksi myös brentuksimabivedotiinihoitoa. Sekä brentuksimabivedotiini että PD1-estäjähoidolla autologiseen tai allogeeniseen kantasolusiirtoon päästiin etenemään noin kolmasosan potilaista kohdalla. Kaikkien aineiston potilaiden tauti uusiutui BV-hoidon jälkeen. PD1-estäjähoidon jälkeen HL uusiutui noin puolella potilaista. Seurannan päättyessä kolme potilasta oli kuollut. Elossa olevista potilaista syöpä oli uusiutunut tai hoitoja oli yhä käynnissä kolmasosalla, loput potilaat olivat remissiossa. Suurin osa potilaista raportoi jotain haittoja PD1- tai BV-hoitoon liittyen, suurin osa näistä haitoista oli lieviä. Hoidon keskeytykseen johtaneita haittoja oli yhdellä PD1- estäjää saaneella potilaalla. Johtopäätökset: Aineisto tukee uusien biologisten lääkkeiden käyttöä edeltävästi paljon hoitoja saaneiden Hodgkinin lymfoomapotilaiden kohdalla. Lääkkeillä voidaan päästä etenemään potentiaalisesti kuratiivisiin kantasolusiirteisiin.
  • Mäkinen, Jennika (2015)
    Juurihoito koetaan työläänä ja aikaa vievänä, siksi sen eri vaiheista pyritään tekemään helpompaa ja nopeampaa. Uusimmissa koneellisissa menetelmissä käytetään vain yhtä tai muutamaa instrumenttia juurikanavan preparointiin Tutkimuksen tavoitteena oli selvittää, voidaanko yhden tai kolmen viilan koneellisilla preparointimenetelmillä säästää aikaa ja saavuttaa enemmän tehokkuutta kuin perinteisillä useampiin instrumentteihin perustuvilla menetelmillä ilman, että preparoinnin laatu kärsii. Tutkittavat menetelmät olivat resiprokaatiota hyödyntävä yhden instrumentin menetelmä, tasaista pyörimisliikettä hyödyntävä yhden instrumentin menetelmä sekä resiprokaatiota ja tasaista pyörimisliikettä hyödyntävä kolmen instrumentin menetelmä. Preparointiin käytettyä aikaa, kanavamorfologian säilymistä ja juurentäytteiden tiiviyttä arvioitiin akryyliblokeista ja humaanihampaista sekä visuaalisesti että laskennallisen mallin mukaan. Yhden tai kolmen instrumentin menetelmät olivat jonkin verran nopeampia kanavan preparoinnissa kuin perinteinen menetelmä. Juurikanavan esilaajentaminen vaikutti kanavamorfologian säilymiseen suotuisasti. Preparoinnin jälkeen poikkileikkaukseltaan pyöreissä kanavissa juurentäytteet olivat tiiviimpiä verrattuna epäsäännöllisen muotoisiin kanaviin. Aiempaa koonisemmat instrumentit vaativat ainakin ahtaissa kanavissa juurikanavan esilaajennuksen, jotta kanavamorfologia säilyisi. Jos esilaajennus tehdään koneellisesti, ei voida enää puhua yhden viilan menetelmästä.
  • Vartiainen, Henri (2014)
    Sydämen vajaatoimintapotilaiden heikosta ennusteesta johtuen uusien lääkeaineiden kehitys ja tutkiminen on tärkeää. Tutkimuksen tavoitteena oli selvittää levosimendaanin ja kahden uuden lääkeaineen, mitoTEMPO:n sekä omecamtiv mecarbil:n suoria ja lääkealtistuksen vaikutuksia rotan sydämen mitokondrioihin. Joko terveen tai iskemia-reperfuusivaurion omaavan rotan sydämestä otettiin kudosnäyte, jonka mitokondriot eroteltiin PBI shredder laitteella. Mitokondrioiden hapenkulutusta mitattiin kahdella eri protokollalla Oroboros oxygraph 2k laitteella. Kontrolliin verrattuna iskemia-reperfuusiovaurio kasvatti mitokondrioiden hapenkulutusarvoja ja heikensi kytkentäastearvoja. Ennen vauriota suorittu rottien altistaminen omecamtiv mecarbille tai mitoTEMPO:lle sai aikaan hapenkulutusarvojen ja mitokondrioiden kytkentäastearvojen siirtymisen kohti kontrolliarvoja. Levosimendaanialtistuksen seurauksena mitokondrioiden kytkentäastearvot pysyivät vaurioituneen sydämen tasolla. MitoTEMPO oli ainut lääkeaine, jolla näyttäisi olevan suoria vaikutuksia mitokondrioihin. Tutkimus osoitti, että käytetty tutkimusmenetelmä on toistettava ja helppo toteuttaa. Jatkossa tulos mahdollistaa saman tutkimusmenetelmän käytön muiden eläinten näytteiden ja potilasnäytteiden tutkimiseen. Lisäksi tutkimuksen perusteella omecamtiv mecarbil ja mitoTEMPO suojaavat sydämen mitokondrioita iskemiareperfuusiovaurioilta.
  • Myöhänen, Meri (2017)
    Tässä tutkielmassa testataan laskennallisten, signaalin jatkuvuuteen tai synkronisuuteen perustuvien EEG-mittareiden toimivuutta hypoksis-iskeemisestä enkefalopatiasta (HIE) kärsineiden vastasyntyneiden akuutin tilan sekä ennusteen arvioinnissa. Lisäksi on tutkittu EEG-signaalin synkronisuutta mittaavan ASI-indeksin erottelukykyä terveiden ja asfyktisten lasten erottelussa. Tutkimus on toteutettu analysoimalla EEG-mittareiden arvoja suhteessa vastasyntyneiden kliiniseen enkefalopatian vaikeusasteen arvioon sekä parin vuoden sisällä tehtyyn uuteen neonatologin arvioon lapsen kehityksestä. Lisäksi HIE-potilaiden ASI-arvoja verrattiin terveiden verrokkien vastaaviin arvoihin. Jatkuvuutta mittaavista MFDFA-muuttujista havaittiin tilastollisesti merkitseviä eroja kolmessa mittarissa HIE- ja kahdessa ennusteryhmien suhteen. Ryhmien välille ei kuitenkaan löytynyt selviä raja-arvoja. ASI ei erotellut alaryhmiä, mutta toimi kiitettävästi terveiden ja HIE:stä kärsineiden erottelussa. Tutkimus tukee tuloksia ASI:n käytettävyydestä terveiden ja enkefalopatiasta kärsivien vastasyntyneiden erottelussa, mutta antaa todistetta HIE-alaryhmien välisen diagnostiikan toimivuutta vastaan. HIE:n vaikeusasteen ja ennusteryhmien erottelussa lupaavampia tuloksia antaneita MFDFA-mittareita voisi kehittää ja testata suuremmissa aineistoissa.
  • Mäki, Niina (2019)
    Tutkielman tarkoituksena oli tuottaa kirjallisuuskatsaus karieksen diagnostiikassa käytettävistä optisista karieksen havainnointimenetelmistä. Tutkielmassa käsitellään aluksi karieksen havainnointia visuaalisesti ja röntgentutkimuksin ja lopuksi perehdytään karieksen optisiin havainnointimenetelmiin. Aineisto kerättiin PubMed -tietokannasta. Hakusanoina käytettiin: VistaCam, DIAGNOcam, NILT, fluorescence and caries, DIAGNOdent, occlusal caries detection ja approximal caries detection. Optisia karieksen havainnointimenetelmiä ovat esimerkiksi DIAGNOcam (DC) ja VistaCam (VC). Optiset karieksen havainnointimenetelmät ovat ei-ionisoivia kuvausmenetelmiä, joissa laite tuottaa valon eri aallonpituuksia. DC-kamera tuottaa röntgenkuvien kaltaisia mustavalkoisia kuvia. DC:ssa aallonpituudeltaan 780 nm valoa johdetaan valokuitua pitkin pehmytkudoksen läpi ja sieltä hampaan kruunua pitkin okklusaalipintaa vasten olevaan sensoriin. Sensori rekisteröi hampaan läpäisseen valon ja tuottaa digitaalisen kuvan. VC-kameran toiminta perustuu fluoresenssiin. VC-laite tuottaa valoa kahdesta LED-valonlähteestä, joiden aallonpituus on 405 nm. Laitteen kamera rekisteröi fluoresenssin ja tuottaa digitaalisen kuvan, missä rakenteet näkyvät eri värein ja numeerisina arvoina 0-4. Kirjallisuuden perusteella DC ja VC ovat hyviä apuvälineitä visuaalisen havainnoinnin ja röntgentutkimuksien lisäksi, mutta eivät kuitenkaan ensisijaisia menetelmiä. Ensisijaisia kariesdiagnostiikan menetelmiä ovat visuaalinen havainnointi ja röntgentutkimus. DC-kuvia verrattiin useissa tutkimuksissa bitewing-kuviin ja DC-laitteen havainnointikyky kariesvaurioissa oli yhtä hyvä tai parempi kuin bitewing-kuvissa. VC-laitteesta oli vähemmän tutkimuksia kuin DC-laitteesta, mutta ne osoittivat VC:n olevan hyvä apuväline okklusaalipinnan kariesvaurioiden havainnoimisessa. Ei-invasiisivisena, ionisoivaa säteilyä lähettämättömänä DC- ja VC tutkimus voitaisiin toistaa usein ja tutkimus voitaisiin tehdä myös suuhygienistin toimesta.
  • Laitinen, Jens (2014)
    Nykyiset DNA:n eristämiseen ja puhdistamiseen käytetyt myrkyttömät proteiinien ulossuolausmenetelmät (protein-salting-out) ovat vielä melko aikaavieviä ja eräissä tilanteissa jopa epäluotettavia. Tämän työn tarkoituksena on kehittää luotettava ja entisiä menetelmiä nopeampi proteiinien ulossuolausmenetelmä kromosomaalisen DNA:n eristämiseksi viljellyistä ihmisen soluista (Jurkat, K562 ja U937). Tämän uuden proteiinien ulossuolausmenetelmän avulla voidaan 60 minuutissa eristää puhdasta ja suurimolekyylimassaista DNA:ta erilaisiin vaativiin sovelluksiin, kuten genomisten DNA kirjastojen valmistukseen ja niiden analyysiin. Tässä työssä kehitetty DNA:n eristysmenetelmä validoitiin tekemällä puhdistetusta DNA:sta geenikirjasto, josta vektoretti-PCR:ään perustuvalla kromosomikävelyllä eristettiin ihmisen kasvurajoitegeenin, tp53-geenin, promoottorialue, joka analysoitiin restriktioentsyymikartoituksella ja sekvennoinilla.
  • Kiiski, Ilona (2022)
    Naming is part of word-finding process where we retrieve words from our mental lexicon. Word retrieval is one of the fundamental procedures in linguistic processing. Aphasia is a linguistic disorder caused by a cerebrovascular accident. Word-finding or naming difficulty is the most common symptom of aphasia. Normal aging is also associated with decline in word-finding and naming abilities. The aim of this study was to investigate how healthy young adults, healthy elder participants and subacute aphasic participants perform in novel word naming task. Subacute aphasic participants performance in the naming task was compared with data collected on the performance of healthy control groups. In addition, the connection between performance in the novel word recognition task and in the naming task ability was examined. There was a total of 50 participants in this study. The sample of the study consisted of three groups: subacute aphasic participants (n=10), healthy young adults (n=20) and healthy elder participants (n=20). On first occasion the word learning task was completed on a computer program where participants practiced six pseudoword-picture pairings. Novel word learning was measured by word recognition task and naming task on two different occasions that were one week apart from each other. The performance in the naming task differentiated significantly between all the groups. Healthy young adults performed significantly better than subacute aphasic participants. Subacute aphasic participants’ and healthy elder participants’ performance in the naming task was close to significance. However, it can’t be inferred from the result that there is no difference in performance between these groups. There was a significant difference between performance of the healthy elderly participants and the healthy young adults. There was a correlation between the performance in the word recognition task and word naming task when investigating the whole sample. There was no correlation found between the two tasks when the groups were assessed independently. Additionally, this study provides new research data of the naming ability of young healthy adults, the elderly and subacute aphasic participants.
  • Heikkilä, Anna (2021)
    Aphasia is a linguistic disorder that occurs after language acquisition and can lead to difficulties with expressive and receptive language. Aphasia is most often caused by a stroke. The inability to retrieve words, also known as anomia, is the most common symptom of aphasia and it is most often assessed with object-naming tasks. It is acknowledged that in aphasia learning is fundamental aspect of the recovery process and this has led to increasing interest to study novel word learning ability in aphasia. So far, word learning ability in people with aphasia has been studied mainly in chronic stage. The aim of this study was to examine novel word learning ability in subacute aphasia using recognition and naming task and to investigate the possible connection between recognition and naming ability. Additionally, the possible connection between naming of familiar objects and new objects was investigated. The sample of this study was part of the Opi sanoja research project and included ten adults with subacute aphasia (maximum 3 months post-stroke). Participants completed a learning task on computer and their aim was to learn six pseudoword-picture pairings. The novel word learning ability of the participants was assessed using recognition and confrontation naming task. The tasks were administered on two different occasions one week apart from each other. The ability to name familiar objects was assessed using Boston Naming Test. Participants’ ability to name novel objects wasn’t correlated with their ability to recognize the novel objects. Furthermore, participants’ ability to name familiar objects didn’t correlate with the ability to name novel objects. However, there was considerable inter-individual variability in learning performance. Some of the participants were able to recognize novel objects at the statistically significant level immediately after the learning task and one week later. However, some of the participant’s couldn’t recognize the objects either immediately after the learning task or one week later. At the group level participants’ performance on the novel object naming task was poor and was virtually at floor. However, consideration of individual participant results revealed that one of the participants was able to name some of the novel objects correctly. Based on the results, people in subacute aphasia recognize novel targets better than name them. The results are in line with previous studies that have investigated ability to learn new words in chronic aphasia and support the initial evidence that people with subacute aphasia can learn novel words. The findings of this study also provide preliminary understanding of the ability to name novel objects in subacute aphasia.
  • Majatsalo, Riitta (2020)
    Background. One way to define aphasia is to consider it as an impairment of language functions emerging after the period of language acquisition. Aphasia is most often due to an ischemic or hemorrahagic stroke and causes common problems in word retrieval, naming as well as expressive and receptive language skills. The symptoms of aphasia may be mild moderate, severe or most severe depending on the lesion size and location. The recovery from aphasia is based on the reorganization of neural networks in the brain and is generally divided into three main phases: acute, subacute and chronic. Acquisition of novel words requires intensive exposition to them through hearing or seeing as well as a good functioning of short-term and long-term memories. There has been only a little research in acquisition of novel words in subacute aphasia. Objectives. The aim of this thesis is to investigate the ability of a person in subacute phase of aphasia to learn novel words in a situation resembling ambiguous natural language learning context. Another aim is to study the connection between the learning ability and the language profile of the participant. Methods. The research material consisted of background information of the participant as well as the results of linguistic-cognitive tests and the novel word learning test. In the last-mentioned the participant learned six nonwords and their picture referents cross-situationally which means that the correct word-referent pairs develop gradually with the help of participant's own observations and feedback. Results and conclusions. Compared to the results of the nearest study available as to the study design the participant showed both statistically significant ability to learn novel words and also ability to store the new material during one week after the testing. In spite of a severe aphasia the participant reached the highest learning results together a chronic participant whose aphasia severity grade was mild. One possible explanation to this may be that the participant could make a successful advantage of both the residual of the linguistic-cognitive profile as well as the visual modality of the word learning task.
  • Martinsuo, Maija (2019)
    Background. Aphasia refers to a disability in the processing of linguistic information. It is most typically due to a stroke. Aphasia impairs a person's ability to understand, produce and use language. Recovery from aphasia is generally divided into three main stages: acute, subacute and chronic. So far, the ability to learn new words in aphasia has only been studied in chronic aphasia. Learning new words is a complex process. In natural language learning, the relationship between a word and its meaning is often not unambiguous, but the words and their possible meanings are numerous, and the connections are complex. The learning of new words can take place by hearing or by reading. The prerequisite for rehabilitation from aphasia is the ability to learn new things, but aphasia research typically uses familiar and everyday words. However, the use of familiar words in research makes it difficult to interpret the results. In order to assess whether a person with aphasia is able to learn new vocabulary, research must be done on a vocabulary that was not available to the person before aphasia. Objectives. The aim of this thesis is to determine, whether people with subacute aphasia can learn novel vocabulary in a situation that imitates natural language learning. This thesis also investigates how the learning ability of people with aphasia compares to the learning ability of healthy matched controls in the same task and how the matched controls learn compared to healthy young adults. Methods. The participants of the study consisted of three groups: young controls, matched controls and aphasic participants. The aphasic participants were examined at HUS Hospital District in Laakso Hospital in Helsinki and in Hyvinkää Hospital. The word learning task consisted of six 3-syllable nonwords that were practiced using a computer program. The task was to combine a spoken and written novel word with the correct novel image, choosing from two different images. Results and conclusions. Learning novel words is possible in subacute aphasia. However, there was great variability in the ability to learn between the aphasic participants. Some learned the words well, others learned some words, and some did not seem to learn the words at all. In addition, some of aphasic participants in the subacute stage were able to maintain the vocabulary they learned for at least a week after learning. Some of the aphasic participants learned the words on par with matched controls but for some the learning was significantly weaker. Both young adults and matched controls performed well on the learning task, but young adults learn the words faster than matched controls.
  • Vehviläinen, Juho (2018)
    Aivovammat ovat merkittävä sairastavuutta ja kuolleisuutta lisäävä vamma. Pään tietokonetomografiatutkimukset ovat aivovammojen akuutissa diagnostiikassa välttämättömiä toimenpiteiden tarpeen ja potilaiden ennusteen arvioinnissa. Uusia menetelmiä näiden tietokonetomografiakuvausten antaman informaation tulkitsemiseen potilaan ennusteen kannalta on kehitetty, mutta menetelmiä ei ole validoitu laajassa mittakaavassa. Tässä tutkimuksessa arvioitiin pään tietokonetomografiaan perustuvien Stockholm CT ja Helsinki CT -pisteytyksien antamaa arviota aivovammapotilaiden ennusteesta ensimmäisen sairaalassa otetun pään tietokonetomografiakuvan perusteella. Tuloksia verrattiin Rotterdam CT -pisteytykseen sekä Marshall CT -luokitukseen, yleisesti käytettyihin kliinisiin ennusteparametreihin kuten ikä, pupillareaktiot, Glasgow Coma Scale (GCS), veren glukoosipitoisuus ja hemoglobiini, ja edelleen päätetapahtumiin, jotka luokiteltiin Glasgow Outcome Score (GOS) -pisteytyksen avulla. Tutkimuksen potilasjoukkona olivat Tukholman Karoliinisessa yliopistosairaalassa vuosina 2005 – 2014 tehohoitoa vaatineet aivovammapotilaat sekä vastaava potilasjoukko Helsingin ja Uudenmaan sairaanhoitopiirin Töölön sairaalasta vuosilta 2013-2014. Potilaita oli tutkimuksessa yhteensä 1115. Tutkimuksessa selvisi Stockholm CT ja Helsinki CT -pisteytyksien antavan enemmän tietoa aivovamman vakavuudesta sekä tarjoavan tarkemman kuvan potilaan ennusteesta kuin aikaisemmin kehitetyt pisteytykset. Merkittävin yksittäinen ennusteeseen vaikuttava tekijä kuvantamisessa ilmenneistä löydöksistä oli traumaattinen lukinkalvonalainen verenvuoto. Tutkimuksen tärkeimmät rajoitteet liittyivät tutkimuksen retrospektiiviseen asetelmaan, puuttuviin potilastietoihin ja vaihteleviin potilaiden seuranta-aikoihin. Tämä lääketieteen syventävien opintojen kirjallinen työ perustuu PLOS Medicine -lehdessä julkaistuun artikkeliin ”Evaluation of novel computerized tomography scoring systems in human traumatic brain injury: An observational, multicenter study”.
  • Järviö, Johanna (2016)
    Uuteen neurokirurgiseen toimenpiteeseen johtava postoperatiivinen hematooma (POH) on harvinainen mutta vakava toimenpiteen jälkeinen komplikaatio, joka liittyy selvästi lisääntyneeseen morbiditeettiin ja mortaliteettiin. Kirjallisuudessa postoperatiivisten hematoomien esiintyvyys on vaihdellut eri toimenpideyksiköiden välillä, antaen keskimääräiseksi esiintyvyydeksi 1.1%-2.2%. Tutkimuksessamme on retrospektiivinen asiakirjatutkimus, tavoitteenamme oli selvittää HUS:n neurokirurgian yksikön uuteen toimenpiteeseen johtavien postoperatiivisten hematoomien esiintyvyys eri neurokirurgisissa toimenpidetyypeissä vuosina 2010-2012. POH todettiin 0.64%:lla kaikista potilaista. Kraniotomioissa POH:n esiintyvyydeksi saimme 0.55% (n=26/4726) ja spinaalikirurgiassa 1.05% (n=30/2870). Eniten postoperatiivisia vuotoja havaittiin dekompressoiduissa kraniektomioissa (7.87%) ja kranioplastioissa (3.57%). Spinaalikirurgiassa POH:n esiintyvyys oli 1.1% kaularanganalueen ja 2.1% rintaranganalueen toimenpiteissä. Postoperatiivista hypertensiota havaittiin 64%:lla kaikista POH:n saaneista potilasta ja 85%:lla kraniotomiapotilaista. Kaikista potilaista, joilla todettiin intrakraniaalinen hematooma, 41%:lla evakuaatioleikkauksen jälkeinen lopputulos oli huono (GOS 1-3) ja 22% potilaista menehtyi kuuden kuukauden seurannan aikana. Neurokirurgian haastavuudesta huolimatta postoperatiivinen hematooma on harvinainen komplikaatio, jonka ehkäisemiseksi on oleellista tunnistaa suuremman riskin toimenpidetyypit ja mahdolliset vielä tuntemattomat verenvuodon riskitekijät