Skip to main content
Login | Suomeksi | På svenska | In English

Browsing by Title

Sort by: Order: Results:

  • Laukkanen, Mikko (2017)
    This Planning Geography master's thesis studies the planned boulevardizations in Helsinki in the context of city-regionalism and land-use conflicts between municipalities. Interest conflicts inside regional growth machines are typical and the examination of these interest conflicts and their effects on the city-region and its growth dynamics is the corner stone of this thesis. The first objective was to examine how the planned boulevardizations can affect the local growth dynamics of Greater Helsinki Region in the context of sustainable development. The secondary objective was to examine what kinds of conflict types can be detected from the boulevardization induced interest conflicts and do they produce any positive outcomes. Boulevardizations have been implemented for various reasons. However, the new general plan in Helsinki aims to utilize the exclusion areas of highways to densify the urban structure and expand the urban core outwards. By turning urban freeways to boulevards, the exclusion areas can be built into residential areas that fulfil the need to densify the urban structure and cater to the need to produce housing into an urban environment. The research was carried out as a qualitative case study. The primary data was gathered from thirteen expert interviews. The interviewees were planning officials from the cities of Helsinki, Vantaa, Porvoo, Kerava, Hyvinkää and Lahti, and from the municipalities of Kirkkonummi, Sipoo, Tuusula and Vihti. The main theoretical background in this thesis rely on the neoliberalization of land-use and the growth machine theory, which were used to examine the inter-municipal land-use conflicts in the context of city-regionalism and sustainable development. The research shows that the Greater Helsinki city-region functions as a growth machine and the planned boulevardizations can affect its growth dynamics and can have an influence on where and how the regional growth will occur. The boulevardizations could also affect the growth dynamics between the surrounding municipalities. Infact, some of the municipalities can gain from the boulevardizations directly, when the first boulevardizations are implemented. The order in which urban freeways are turned into boulevards is a significant issue regarding the municipalities surrounding Helsinki and creates an interesting temporal aspect to the boulevardizations, which can induce conflicts and tensions in city-regionalism. The research revealed set of different conflict types that were categorized as interest, informational and value conflicts. The location of future growth in the Greater Helsinki region is the most obvious interest conflict in the process. Also, freeway infrastructure is seen as common property, which was a cause of conflicts. Experienced lack of participation is a source of informational conflicts. In this case municipalities were participated in the planning process in some extent, but the level of participation varied. Direct interaction and participation in the future could make a difference and brought a more substantial feeling of participation and regionalism. A significant reason behind land-use conflicts between officials seems to be a paradigm shift, that has occurred as planning in Helsinki has become more inclined to carbon neutrality and walkability, in other words, sustainable development. Also, the change of generation can lessen the probability of successful communication between officials as well. The planned boulevardizations have strengthened the communication between municipalities and legitimized existing organizations for cooperation, which can be seen as a positive outcome.
  • Oikari, Tuomas (2018)
    Tämän työn päämäärä on kehitellä Lp−estimointi tekniikoita, soveltaa niitä mallioperaattoreiden tutkimiseen, ja edelleen, siirtää näiden mallioperaattoreiden rajoittuneisuus ominaisuuksia bilineaariselle Calderón-Zygmund -operaattorille. Tämä siirtäminen tehdään olettamalla tunnetuksi Bilineaarisen Calderón-Zygmund -operaattorin esityslause satunnaistettujen mallioperaattoreiden summana. Oletamme tunnetuksi hieman interpolointi ja maksimaalifunktioiden teoriaa. Aloitamme esittelemällä hyödyllisiä peruskäsitteitä, mm. neliöfunktion, sen kautta Lp -avaruuksien karakterisaation, ja Haarin kannan. Kappaleissa kaksi ja kolme määrittelemme mallioperattorit: shiftit ja paratulot ja todistamme niitä koskevia vahvoja estimaatteja Lp -avaruuksissa, kun p > 1. Tarkoituksemme on interpoloida vahvoja estimaatteja quasi-Banach alueelle, siis kun p < 1, ja tätä varten todistamme heikkoja päätepiste estimaatteja. Neljäs kappale on omistettu interpolointitekniikan esittelemiselle, joka mahdollistaa edellämainitun interpoloinnin. Viidennessä ja viimeisessä kappaleessa määrittelemme bilineaarisen Calderó-Zygmund operaattorin, kokoamme yhteen aikaisemmin kehitetyn teorian tuloksia ja vedämme näistä tuloksista lyhyehkönä korollaarina bilineaarisen Calderón-Zygmund -operaattorin rajoittuneisuuden.
  • Markkanen, Jani (2012)
    B-puut ovat yleisesti käytettyjä hakemistopuita. Tutkielmassa tutustutaan B-puiden samanaikaisuudenhallintaan ja elvytykseen erityisesti tietokannanhallintajärjestelmän kannalta. Tehokkaan samanaikaisuudenhallinnan tarjoavan Blink-puun algoritmeista esitellään solmujen poistojen seurantaan ja läpikäydessä rakennemuutoksien viimeistelyyn perustuvat algoritmit. Näistä jälkimmäinen toteutetaan ja sen tehokkuutta arvioidaan kokeellisesti. Kokeellisessa arvioinnissa huomataan, että lisäys- ja poisto-operaatioissa samanaikaisuudenhallinnan kustannus nousee jopa 94 %:iin arvioinnin maksimioperaatiotiheydellä. Samalla maksimioperaatiotiheydellä hakuoperaation samanaikaisuudenhallinta vie alle prosentin kokonaisajasta. Korkea samanaikaisuudenhallinnan kustannus lisäys- ja poisto-operaatioissa johtuu päivitysoperaatioiden U-salpaamasta juurisolmusta. Juurisolmun U-salpaus on usein turhan vahva toimenpide, sillä sitä tarvitaan vain 0,06 % päivitysoperaatioita, kun salpa halutaan korottaa kirjoittamista varten X-salvaksi. Puun juuren ruuhkan helpottamiseksi esitellään algoritmille jatkokehitysideoita, jotka perustuvat juuren U-salpauksen tarpeen harvinaisuuteen ja mahdollisuuteen aloittaa puun läpikäynti aina uudelleen puun juuresta.
  • Alander, Eeva-Liisa (2014)
    Tehdyssä Pro Gradu-tutkielmassa perehdyttiin Brønsted-happamien ioniliuottimien käyttöön happokatalyytteinä synteettisessä kemiassa. Tutkimuksen tarkoituksena oli selvittää Brønsted-happoioniliuottimien käyttösovellukset katalyytteinä erityyppisissä orgaanisen kemian reaktioissa ja selvittää niiden happamuudet, happamuuden määritystavat sekä ioniliuottimen rakenteen vaikutus happamuuteen. Brønsted-happoioniliuottimien käyttö katalyytteinä syntetiikassa on ollut viime vuosien aikana kasvavan mielenkiinnon kohde. Tämä johtuu Brønsted-happoioniliuottimien yleisesti hyvästä katalyyttisesta tehokkuudesta, reaktiotuotteiden helposta eristyksestä sekä käytetyn ioniliuottimen kierrätettävyydestä. Yleisimpänä esimerkkinä Brønsted-happoioniliuottimen katalysoimasta orgaanisen kemian reaktiosta ovat erityyppiset esteröintireaktiot, mutta happamia ioniliuottimia voidaan käyttää katalyytteinä myös monissa muissa orgaanisen kemian reaktioissa, kuten Prins-reaktiot, nitrausreaktiot, Diels-Alder-reaktiot sekä monikomponenttireaktiot. Pro Gradun kokeellisessa osuudessa valmistettiin ensin useita erilaisia Brønsted-happoioniliuottimia, jonka jälkeen niiden katalyyttista tehokkuutta testattiin erilaisilla Fischer-esteröintireaktioilla. Parhaiten katalyytteinä toimineet ioniliuottimet valittiin katalysoimaan muutamaa oseltamiviirin synteesissä esiintyvää reaktiota.
  • Hallamaa, Luukas (2019)
    The purpose of this thesis is to present some dimension theory of separable metric spaces, and with the theory developed, prove Brouwer’s Theorem on the Invariance of Domain. This theorem states, that if we embed a subset of the n-dimensional Euclidean space into the aforementioned space, this embedding is an open map. We begin by revising some elementary theory of point-set topology, that should be familiar to any graduate student in mathematics. Drawing from these rudiments, we move on to the concept of dimension. The dimension theory presented is based on the notion of the small inductive dimension. We define this dimension function for regular spaces and state and prove various results that hold for this function. Although this dimension function is defined on regular spaces, we mainly focus on separable metric spaces. Among other things, we prove that the small inductive dimension of the Euclidean n-space is exactly n. This proof makes use of the famous Brouwer Fixed-Point Theorem, which we naturally also prove. We give a combinatorial proof of the Fixed-Point Theorem, which relies on Sperner’s lemma. We move on to develop some theory regarding the extensions of functions. These various results on extensions allow us to finally prove the theorem that lent its name to this thesis: Brouwer’s Theorem on the Invariance of Domain.
  • Suominen, Miia (2014)
    Alkuluvuista on tiedetty tuhansia vuosia, ja jo antiikin aikaan onnistuttiin todistamaan, että alkulukuja on ääretön määrä. Alkulukukaksonen on puolestaan käsitteenä uudempi. Vain osa alkuluvuista on alkukulukukaksosia, mutta alkulukukaksosten lukumäärää ei ole onnistuttu vielä määrittämään. Alkulukukaksosten käänteislukujen summan tiedetään suppenevan ja tämän todistus esitetään tässä työssä. Johdannon ja alkulukujen lyhyen historian jälkeen perehdytään lukuteorian perusteisiin. Ensimmäiseksi käsitellään kokonaislukujen jaollisuutta ja niiden hajottamista alkutekijöihin. Tämän jälkeen todistetaan alkutekijähajotelman yksikäsitteisyys ja se, että alkulukuja on ääretön määrä. Lisäksi määritellään suurin yhteinen tekijä, pienin yhteinen jaettava, sekä kongruenssi ja todistetaan muutamia kongruenssiin liittyviä apulauseita. Kongruenssin käsittelyn jälkeen esitellään ja todistetaan Kiinalainen jäännöslause. Käsitteiden määrittelyn jälkeen tutustutaan Brunin seulaan ja todistetaan sen yksinkertaisin muoto. Tämän lisäksi esitellään kaksi lemmaa, jotka käsittelevät korkeintaan annettua lukua olevien kokonaislukujen (jotka totetuttavat määrätyn kongruenssin) lukumäärää. Tästä siirrytään todistamaan Mertensin kaava. Viimeinen osa työstä käsittelee kahta alkulukukaksosiin liittyvää lausetta. Ensimmäisessä todistetaan yläraja sellaisten alkulukukaksosten lukumäärälle, jotka eivät ole annettua lukua suurempia. Jälkimmäisessä lauseessa todistetaan alkulukukaksosten käänteislukujen summien suppeneminen.
  • Tamminen, Mira Johanna (2016)
    Vakuutusten hinnoittelussa ongelmaksi muodostuu vakuutusmaksun oikean tason löytyminen huomioiden vakuutetun sekä yhtiön intressit. Työssä ongelmaa lähestytään credibility-teorian avulla ja ratkaisuna tähän ongelmaan esitetään Bühlmann-Straub-malli. Vakuutusmaksu koostuu useasta eri osasta, tässä tutkielmassa kiinnostukseen kohteena on riskimaksu. Riskimaksu on se osa vakuutusmaksua, joka kohdistuu suoraan korvauksiin. Aluksi riskimaksu määritetään yhdelle vakuutetulle, nojautuen vakuutetun omaan vakuutushistoriaan. Esitetään myös kollektiivin riskimaksu, jossa huomioidaan se tosiasia että vakuutettu kuuluu joukkoon samankaltaisia vakuutettuja. Todellisuudessa riskimaksu on kuitenkin yhdistelmä näistä kahdesta ominaisuudesta. Esitetään credibility-teoriaa hyödyntäen riskimaksulle estimaattori, joka yhdistää vakuutetun oman vahinkohistorian ja sen tosiasian, että vakuutettu kuuluu tiettyyn heterogeeniseen kollektiiviin. Löydetään kertoimet painottamaan näitä ominaisuuksia ja riskimaksulle saadaan sopiva estimaattori, jota kutsutaan credibility-estimaattoriksi ja tämän avulla saatua riskimaksua credibility-maksuksi. Laajennetaan credibility-maksun käsite esitettäväksi L^2- avaruudessa. Tässä yleisessä mallissa ei aiemmin määriteltyjä todennäköisyysjakaumia määritellä tarkasti ja esitetään tärkeitä tuloksia itse Bühlmann-Straub-mallin määrittämistä varten. Lopuksi päästään päälauseeseen. Bühlmann-Straub-malli on laajennus tutkielmassa aiemmin esitetyistä malleista. Mallissa esitetään credibility-estimaattori sekä homogeeninen credibility-estimaattori ja jälkimmäisen avulla credibility-maksu. Tässä laajennetussa mallissa määritelty credibility-maksu ottaa huomioon koko yhtiön koko vakuutuskannan. Esitetään myös malliin liittyviä tunnuslukuja.
  • Horn, Matthew (2024)
    Long term monitoring programs gather important data to understand population trends and man- age biodiversity, including phenological data. The sampling of such data can suffer from left- censoring where the first occurrence of an event coincides with the first sampling time. This can lead to overestimation of the timing of species’ life history events and obscure phenological trends. This study develops a Bayesian survival model to predict and impute the true first occurrence times of Finnish moths in a given sampling season in left-censored cases, thereby estimating the amount of left-censoring and effectively "decensoring" the data. A simulation study was done to test the model on synthetic data and explore how effect size, the severity of censoring, and sampling fre- quency effect the inference. Forward feature selection was done over environmental covariates for a generalized linear survival model with logit link, incorporating both left-censoring and interval censoring. Five-fold cross validation was done to select the best model and see what covariates would be added during the feature selection process. The validation tested the model both in its ability to predict points that were not left-censored and those that were artificially left-censored. The final model included terms for cumulative Growing Degree Days, cumulative Chilling Days, mean spring temperature, cumulative rainfall, and daily minimum temperature, in addition to an intercept term. It was trained on all of the data and predictions were made for the true first occurrence times of the left-censored sites and years.
  • Ignatius, Karoliina (2013)
    The ice crystals in the Earth's atmosphere have a considerable impact on cloud optical and radiative properties, such as reflectivity, cloud dynamics, chemical processes and initiation of precipitation and cloud lifetime. Thus, they directly affect the albedo of Earth which in turn is a significant factor concerning the climate change. The first step of ice formation, the phase transition from liquid to solid, is called ice nucleation. Ice has been identified to form in the atmosphere both homogeneously - without the presence of a foreign substance - and heterogeneously, i.e. induced by pre-existing surfaces. Heterogeneous ice nucleation is the primary pathway of ice formation in the atmosphere. Also homogeneous ice nucleation happens at the upper troposphere, but it requires very low temperatures, whereas in heterogeneous freezing the free energy needed for crystallization is lower and freezing can happen at higher temperatures, normally above -37 ◦C. In heterogeneous ice nucleation, there are four freezing mechanism called modes that describe the onset conditions for freezing. They are called deposition, immersion, condensation and contact modes. The seed particles on which ice forms in heterogeneous ice nucleation are called ice nuclei (IN). Typical IN particles include mineral dust, soot, metal, bacteria and other bioaerosols (pollen, fungal spores), humic-like substances, solid ammonium sulphate, organic acids and volcanic ash. This thesis is a literature survey on the current theoretical knowledge on heterogeneous ice nucleation. It has been long known that the classical nucleation theory (CNT), if employed with one constant contact angle does not reproduce the experimental results. This is due to the fundamental assumptions of CNT: the spherical form of the initial ice embryo having properties of the bulk ice crystal; uniform surfaces; equal nucleation probability for each particle; and stochastic freezing behaviour. To solve this challenge, several theoretical and empirical extensions of CNT have been derived: the use of a distribution of contact angles and active sites; integrating individual nucleation rates over measured size spectra of the IN; and using Ice Nuclei Active Surfaces Sites (INAS) density as a normalized metric from different experiments. As a result of this literature survey, three main lines of research on this field can be distinguished: (1) ice nuclei characterisation; (2) theoretical and empirical modelling of the heterogeneous ice nucleation scheme; (3) parameterising heterogeneous ice nucleation for cloud and climate models. These lines are not altogether separate, but intertwined: knowledge of e.g. the surface properties of the IN is essential for deriving theoretical formulations. Parameterisations, on the other hand, are very much needed in order to obtain knowledge about the indirect climatic effect of ice in the atmosphere.
  • Valo, Tuuli Pauliina (2015)
    This research investigates the post-disaster recovery following typhoon Haiyan that hit the Philippines November 2013. The empirical study was conducted one year after by interviewing crisis-affected people. The first objective of this study is to evaluate the success of post-disaster early recovery from a social perspective focusing on three sectors: livelihoods and income restoration, adequate housing and disaster preparedness. The second objective aims at investigating the disaster resilience of the affected communities and individuals. The factors contributing to disaster resilience are partly deriving from humanitarian aid programs and partly from communities' own systems. In order to build the capacity of atrisk communities to cope with the disasters, the importance of implementing disaster resilience in humanitarian aid has been recognized among researchers. On a broader scale this topic is connected to the role of humanitarian aid in post-disaster recovery. Humanitarian aid is traditionally perceived as a short-term help whereas development aid aims at longer term changes, for instance impacting structural issues in societies. However during the last years the role of the humanitarian aid has been recognized as an initiator for longer term development. Discussion around the different goals of humanitarian and development aid acts as an important part of theoretical framework. Referring to this theoretical discussion this study aims at finding out if any steps have been taken towards longer term goals and bridging relief to development in post-disaster recovery. The evaluation of early recovery is based on different policy papers such as guidelines, plans and standards that provide a frame to analyze the recovery critically. The assessment of early recovery and examination of disaster resilience is conducted through a qualitative case study of three typhoon-affected communities in the province of Samar in Eastern Visayas. Primary data was collected on a field trip in OctNov 2014 in barangays Salvacion, Sawa and Ferreras. Qualitative data collection methods were employed in order to understand the social realities of people's daily lives. The key data collecting method in this study was individual semi-structured interview with crisis-affected people, in addition to which group discussions and key informant interviews were employed to support and challenge the data acquired from individual interviews. Both the policy papers and the data collected from the field were analysed using discourse analysis which emphasizes critical thinking towards the social dynamics and the role of power in each text. The study findings show that a year after the disaster people's major problems were drastically dropped income levels, inadequate housing and inability to restore livelihoods. Emergency phase had been successful however the critical shift from short-term aid to long-term development framework had not yet been purely successful. Nevertheless some important steps had been taken. Humanitarian assistance was not only distributing goods but it included housing programs, emergency employment and livelihood support. Communities' own resilience systems in terms of social capital played an important role in disaster recovery.
  • Levitski, Andres (2016)
    With the increase in bandwidths available for internet users, cloud storage services have emerged to offer home users an easy way to share files and extend the storage space available for them. Most systems offer a limited free storage quota and combining these resources from multiple providers could be intriguing to cost-oriented users. In this study, we will implement a virtual file system that utilizes multiple different commercial cloud storage services (Dropbox, Google Drive, Microsoft OneDrive) to store its data. The data will be distributed among the different services and the structure of the data will be managed locally by the file system. The file system will be run in user space using FUSE and will use APIs provided by the cloud storage services to access the data. Our goal is to show that it is feasible to combine the free space offered by multiple services into a single easily accessible storage medium. Building such a system requires making design choices in multiple problem areas ranging from data distribution and performance to data integrity and data security. We will show how our file system is designed to address these requirements and will then conduct several tests to measure and analyze the level of performance provided by our system in different file system operation scenarios. The results will also be compared to the performance of using the distinct cloud storage services directly without distributing the data. This will help us to estimate the overhead or possible gain in performance caused by the distribution of data. It will also help us to locate the bottlenecks of the system. Finally, we will discuss some of the ways that could be used to improve the system based on test results and examples from existing distributed file systems.
  • Osmani, Lirim (2013)
    With the recent advances in efficient virtualization techniques in using commodity servers cloud computing has emerged as a powerful technology to meet new requirements for supporting a new generation of computing services based on utility model. However barriers to widespread adoption still exists and the dominant platform is yet to be seen in years to come. Hence the challenge of providing scalable cloud infrastructures requires a continuous exploration of new technologies and techniques. This thesis describes an experimental investigation of integrating two such open source technologies, OpenStack and GlusterFS, to build our cloud environment. We designed a number of test case scenarios that help us answer the questions around performance, stability and scalability of the cloud infrastructure deployed. Additionally, the work based on this thesis was accepted to the Conference on Computing in High Energy and Nuclear Physics (CHEP2013), and the paper is due for publishing.
  • Hyvärinen, Tommi (2015)
    Tutkielmassani käsitellään Burgersin yhtälön nimellä tunnettua kvasilineaarista osittaisdifferentiaaliyhtälöä, sekä paneudutaan osittaisdifferentiaaliyhtälöiden teoriaan yleisemmin. Fyysikko Johannes Martinus Burgersin mukaan nimetyllä yhtälöllä voidaan kuvata häiriöiden etenemistä fluideissa, ja sitä voidaan soveltaa myös vaikkapa liikenneruuhkien kehittymisen analysointiin. Burgersin yhtälö on esimerkki yleisemmästä säilymislaista. Matemaattisessa fysiikassa säilymislakien mukaan eristetyssä systeemissä vuorovaikutustapahtumissa tiettyjen suureiden kokonaismäärät pysyvät muuttumattomina. Tunnetuin esimerkki säilymislakeihin liittyen on Noetherin lause, jonka mukaan suurella on vastaavuus tietyn systeemin symmetriaominaisuuden kanssa. Esimerkiksi nestedynamiikan Navier-Stokesin yhtälö on esimerkki epähomogeenisesta versiosta säilymislakia. Tutkimukseni alussa esitellään Hamilton-Jakobin yhtälö, sekä sivutaan variaatiolaskentaa, Legendren muunnosta ja Euler-Lagrangen yhtälöitä. Näytetään, miten annettu osittaisdifferentiaaliyhtälö voidaan samaistaa karakteristiseen yhtälöryhmään, joka koostuu tavallisista differentiaaliyhtälöistä. Karakteristinen yhtälöryhmä johdetaan kvasilineaarisen osittaisdifferentiaaliyhtälön tapauksessa ja sille annetaan geometrinen tulkinta. Ensimmäisen luvun lopussa Hamilton-Jacobin yhtälö ratkaistaan Hopf-Lax kaavan avulla. Toisessa ja kolmannessa luvussa esitellään Burgersin yhtälö ja ratkaistaan se karakteristisen yhtälöryhmän avulla. Saatu ratkaisu ei kuitenkaan päde kaikkialla, vaan tapauksissa, joissa karakteristiset käyrät kohtaavat ('shokkikäyrä'), Burgersin yhtälön ratkaisu vaatii ratkaisufunktion ehtojen heikentämistä ja ingraaliratkaisun määrittelemistä. Rankine-Hugoniot-ehto johdetaan ja sen avulla voidaan löytää ratkaisuja tilanteessa, jossa karakteristiset käyrät leikkaavat. Esittelen myös entropia-ehdon, jonka avulla karsitaan 'epäfysikaaliset' ratkaisut pois ja täten saadaan yksikäsitteinen ja yleinen ratkaisu Burgersin yhtälölle. Lopuksi todistan Lax-Oleinikin kaavan, joka antaa ratkaisun yleisemmälle ongelmalle. Lopuksi tälle ratkaisulle räätälöidään entropia-ehto, jotta siitä saadaan yksikäsitteinen.
  • Koolaji, Mohsen (2014)
    Business ecosystems where services from enterprises across the world are marketed and acquired, demand efficient collaborative project management facilities. In particular, reputation and breach management systems are essential in partner selection and proper project delivery. Reputation systems need to provide measurable scales for collection of objective and arbitrable information about members of the ecosystem. In addition, how breaches or disputes can affect reputation of collaborating partners, and how such disputes can be resolved (i.e. breach recovery) are interesting questions. Furthermore, role of business process management (BPM) systems in resolving breach or dispute situations is also an interesting point for study. This thesis proposes modern model-driven reputation and breach management systems of its own, named Reputation and Breach Management System (RAB_MS). Purpose of the RAB_MS is to improve and refine trust between business partners in the business ecosystems. The presented models are based on state of the art techniques of service oriented architecture (SOA). The models are verified by formal automated verification mechanisms in YAWL system, to avoid syntactical, structural, and semantic errors, and interpretation ambiguities. Results of the formal verification mechanisms ensure that the business processes in the proposed reputation and breach management system meet necessary properties such as soundness and weak soundness. In simpler words, RAB_MS have no deadlocks, livelocks, or dead task within its business process models.
  • Koivula, Juho (2021)
    Kirjallisuuskatsauksessa käydään läpi erilaisia menetelmiä C3-substituoitujen indolien synteeseihin 2-alkenyylianiliinityyppisistä lähtöaineista, joiden bentsyylinen asema oli substituoitu. Erityistä huomiota kiinnitetään menetelmiin, joiden reaktiomekanismeiksi ehdotettiin radikaalimekanismeja. Myös näitä ehdotettuja radikaalimekanismeja esitellään tutkielmassa. Kokeellisessa työssä tutkittiin C3-subsituoitujen indolien hapettavaa synteesiä hiilikatalyytin avulla. Lähtöaineina käytettiin bentsyylisesti aryylisubstituoituja 2-alkenyylianiliinijohdannaisia. Joidenkin lähtöaineiden typpeen oli kiinnitetty metoksipyridiini, jonka kiinnitystä varten kehitettiin Buchwald-katalyysi. Hiilikatalyysit tuottivat hyviä saantoja. Korkea elektronitiheys, etenkin aniliinin bentseenirenkaan ja/tai typen aromaattisen substituentin korkea elektronitiheys, oli eduksi. Reaktion mekanismin ehdotetaan alkavan hapettumisella radikaalikationiksi, ja näitä hapetuspotentiaaleja laskettiin aiemmin raportoidun menetelmän mukaisesti. Mikäli indolin 5-renkaan substituutiot (N1, C2, C3) olivat tarpeeksi samankaltaisia, korkea elektronitiheys, matala hapetuspotentiaali ja hyvä saanto korreloivat. Indolin 5-renkaan substituutio on kuitenkin merkittävämpi tekijä kuin hapetuspotentiaali ja/tai korkea elektronitiheys. Pyridiini typen suojaryhmänä toimi katalyysissä ja se onnistuttiin poistamaan helposti. Metoksipyridiini toimi katalyysissä hyvin, mutta sen kvantitatiivinen poistaminen ei onnistunut.
  • Uuksulainen, Pasi (2013)
    Tutkielma on rakenteeltaan kaksiosainen. Kirjallisuustutkimus on tehty Helsingin yliopistossa ja kokeellinen tutkimus Espanjassa (Universidad Complutense de Madrid). Tästä johtuen ensimmäinen osa on kirjoitettu suomeksi ja toinen osa englanniksi. Kirjallisuuskatsauksessa perehdytään C6-substituoitujen pyrimidiininukleosidien valmistukseen. C6-substituoiduilla pyrimidiininukleosideilla on havaittu olevan monia erilaisia biologisia vaikutuksia. C6-substituoiduista pyrmidiininukleosideista ei ole kovin paljon julkaisuja johtuen synteettisten keinojen vähäisyydestä. C6-substituoituja pyrimidiininukleosideja voidaan valmistaa joko yhdistämällä C6-substituoitu silyloitu emäs ja suojattu sokeri tai muokkaamalla suoraan valmiin nukleosidin C6-asemaa. Happamissa olosuhteissa glykosylaatioreaktiolla valmistettujen C6-substituoitujen pyrimidiininukleosidien saantoa voidaan parantaa käyttämällä Friedel-Crafts-katalyyttejä ja suojaamalla emäksen N3-asema. Glykosylaatioreaktiolla valmistettujen pyrimidiininukleosidien C6-asemassa olevat substituentit ovat yleensä pieniä ryhmiä. Valmiin pyrimidiininukleosidin C6-aseman muokkaukseen on useita keinoja, joista palladiumkatalyytit tarjoavat yhden tehokkaimmista keinoista liittää esimerkiksi aryyliryhmiä C6-asemaan. Muokkaamalla valmista nukleosidia vältetään myös glykosylaatioreaktiossa syntyvien N3-isomeerien muodostuminen. Joidenkin substituenttien kohdalla havaittiin N-glykosidisidoksen hajoamista. Kokeellisen tutkimuksen tavoitteena oli valmistaa uusia asymmetrisessä katalyysissä käytettäviä kiraalisia kamferijohdannaisia ligandeja. Kahden kamferijohdannaisen ligandin valmistuksessa saatiin valmistettua lupaavia välituotteita. Kolme polyhydroksyloitunutta norbornaani- johdannaista eivät toimineet kiraalisina ligandeina vaan tuottivat raseemisen seoksen.
  • Raatikka, Vilho (Helsingin yliopistoUniversity of HelsinkiHelsingfors universitet, 2004)
  • Ng, Kim (2012)
    In analysis of structural information for transmembrane (TM) proteins it is ideal to work with a three-dimensional (3D) structure. This is not always possible as determining an accurate 3D structure can be challenging and expensive as pursuing one can take large amounts of time. Sequence analysis is often used as a surrogate to determine a subset of information regarding secondary and tertiary protein structure given the primary structure (an amino acid sequence). Using Equilibrative Nucleoside Transporter member 1 (ENT1) as a model, the objective of predicting secondary and tertiary structure given primary structure is attempted through computational (in silico) methods. The in silico methods include the use of a pipeline of programs spanning both custom made and ready built software. A set of 2034 homologous protein sequences are first obtained from the initial human ENT1 (hENT1) sequence through a BLASTp. This sequence information is then processed to acquire information on variation, conservation, and hydrophobicity through topology prediction, hydropathic moment plots and variation moment plots. Comparing these results with data acquired from Glycerol-3-Phosphate Transporter (GlpT), a protein with a known 3D structure of 3.3 Angstrom resolution is done to assess evidence of evolutionary origin. This in turn allows estimation on the reliability of predictions to be made on aspects of the secondary and tertiary structure for hENT1. The results show that within predicted TM alpha helical regions that there is some level of correlation between the variation of the amino acids within the alpha helical TM region and its orientation towards the membrane. This can be further refined by gathering statistics on other known proteins with a 3D structure for their relationships in TM regions to hydrophobicity and variability. This will aid in secondary and tertiary structure predictions of other TM proteins given further refinement and additional data. In addition, the sequence conservation information obtained should prove to be robust and allow for a large number of sequences to be analyzed to determine conservation of amino acids given a reference protein. Ideally this information will provide aid in determining interesting amino acids for experiments to be done on hENT1.
  • Jure, Pucnik (2023)
    The outsourced emissions, particularly from transport and construction, pose a challenge for cities like Helsinki in achieving carbon neutrality. Helsinki, epitomizing this struggle, unveiled the 'Carbon-neutral Helsinki 2035 Action Plan' in 2018, aiming to achieve carbon neutrality by 2030. However, this plan, primarily employing a production-based emissions accounting method, neglects the crucial aspect of outsourced emissions. This thesis undertakes a focused examination of the outsourced emissions in Helsinki's transport sector, utilizing a consumption-based emissions accounting method, with a particular focus on emissions originating from car traffic. To ensure a comprehensive evaluation of emissions, this study employs a fleet-based life-cycle assessment (LCA) methodology, providing a holistic perspective encompassing the entire life cycle of vehicles. This approach diverges from conventional product-centric LCAs, incorporating the dynamic interplay between production, usage, and disposal. The study's outcomes are contrasting against the City of Helsinki's Business-As-Usual scenario, emphasizing electrification and technological advancements to reduce emission intensity. Key research questions include uncovering disparities between consumption-based and production-based methodologies, assessing the feasibility of Helsinki's emission reduction goals, and exploring differences between fleet-based and traditional LCA approaches. The thesis is organized into eight chapters, delineating the analytical framework, City of Helsinki's emission mitigation efforts, methodology, data, results, and concluding insights. The consumption-based methodology illuminates substantial disparities in emissions compared to the production-based approach, posing formidable challenges for Helsinki's emission reduction aspirations. The study emphasizes the imperative of actively curtailing the number of vehicles and promoting alternative modes of transportation to achieve meaningful reductions. The fleet-based LCA methodology not only provides a nuanced understanding of emissions but also highlights the necessity of considering evolving technologies and lifecycles. To make significant strides in emissions reduction, Helsinki must adopt a comprehensive and transparent approach, surpassing mere reporting standards and actively contributing to global climate efforts. The study underscores the urgency for cities to transcend greenwashing tactics, aligning policies with public sentiment, and committing to tangible actions for a sustainable future.
  • Suhonen, Sannimari (2023)
    Polygenic risk scores (PRSs) estimate the genetic risk of an individual for a certain polygenic disease trait by summing up the effects of multiple variants across the genome affecting the disease risk. Currently, polygenic risk scores (PRSs) are calculated from imputed array genotyping data which is inexpensive to produce use and has standard procedures and pipelines available. However, genotyping arrays are prone to ascertainment bias, which can also lead to biased PRS results in some populations. If PRSs are utilized in healthcare for screening rare diseases, usage of whole-genome sequencing (WGS) instead of array genotyping is desirable, because also individual samples can be analyzed easily. While high-coverage WGS is still significantly more expensive than array genotyping, low-coverage whole genome sequencing (lcWGS) with imputation has been proposed as an alternative for genotyping arrays. In this project, the utility of imputed low-coverage whole-genome sequencing (lcWGS) data in PRS estimation compared to genotyping array data and the impact of the choice of imputation tool for lcWGS data was studied. Down-sampled WGS data with six different low coverages (0.1x-2x) was used to represent lcWGS data. Two different pipelines were used in genotype imputation and haplotype phasing: in the first one, pre-phasing and imputation were performed directly for the genotype likelihoods (GLs) calculated from the down-sampled data, whereas in the second one, the GLs were converted to genotype calls before imputation and phasing. In both pipelines, PRS for 27 disease phenotypes were calculated from the imputed and phased lcWGS data. Imputation and PRS calculation accuracy of the two pipelines were calculated in relation to both genotyping array and high-coverage whole-genome sequencing (hcWGS) data. In both pipelines, imputation and PRS calculation accuracy increased when the down-sampled coverage increased. The second imputation and phasing pipeline lead to better results in both imputation and PRS calculation accuracy. Some differences in PRS accuracy between different phenotypes were also detected. The results show similar patterns to what is seen in other similar publications. However, not quite as high imputation and PRS accuracy as seen in earlier studies could be attained, but possible limitations leading to lower accuracy could be identified. The results also emphasize the importance of choosing suitable imputation and phasing methods for lcWGS data and suggest that methods and pipelines designed particularly for lcWGS should be developed and published.